RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 HEPN1Q6WQI6 88 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF565Q8N9K5 539 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 OR13D1Q8NGV5 346 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 TM2D1Q9BX74 207 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 SESN1Q9Y6P5 492 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 NOTOA8MTQ0 251 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 DEFB112Q30KQ8 113 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 MIDNQ504T8 468 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 NKAPLQ5M9Q1 402 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 BRICD5Q6PL45 260 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 NR2C2APQ86WQ0 139 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 YIPF6Q96EC8 236 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 NICN1Q9BSH3 213 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 CENPOQ9BU64 300 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 ETAA1Q9NY74 926 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.41■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0U1RQK1 487 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PRD5 423 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PRF3 423 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PRM7 423 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 MEIOCA2RUB1 952 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 SMIM30A4D0T7 59 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 AIREO43918 545 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 CA11O75493 328 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 FBP1P09467 338 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 CDK2P24941 298 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 CHATP28329 748 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 SDC2P34741 201 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 C2orf76Q3KRA6 126 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 OR52W1Q6IF63 320 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 PNKDQ8N490 385 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 OR13A1Q8NGR1 328 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 MRGPRDQ8TDS7 321 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 ZDHHC16Q969W1 377 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 LPAR5Q9H1C0 372 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 PRDM13Q9H4Q3 707 aa15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
RABGGTA-208ENST00000558954 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 VENTXO95231 258 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PAHP00439 452 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM189A2Q15884 450 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM133Q9H2Q1 129 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF167Q9H6Y7 350 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CALYQ9NYX4 217 aa15.39■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 UBE2QL1A1L167 161 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM77I1YAP6 450 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 LDLRAD4O15165 306 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 IL1AP01583 271 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 LGALS4P56470 323 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 BAMBIQ13145 260 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 C17orf58Q2M2W7 97 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM89BQ8N5H3 189 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 OR11H6Q8NGC7 330 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 OR13F1Q8NGS4 319 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ZFAND2BQ8WV99 257 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM158Q8WZ71 300 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CLEC7AQ9BXN2 247 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ESM1Q9NQ30 184 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB22AQ9UL26 194 aa15.38■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0A6YYD4 124 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ODF3BA8MYP8 253 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MMP23AO75900 390 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MT-ND4P03905 459 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ARG1P05089 322 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CGB3P0DN86 165 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 CGB7P0DN87 165 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 RAB6AP20340 208 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 GZMHP20718 246 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 OMGP23515 440 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SSTR5P35346 364 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 MXD1Q05195 221 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF626Q68DY1 528 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 Q6YL49 198 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 LDLRAD3Q86YD5 345 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 GAPTQ8N292 157 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 ZDHHC22Q8N966 263 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 OR56B1Q8NGI3 324 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 KIRREL1Q96J84 757 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 FUNDC2Q9BWH2 189 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 LINC00574Q9H8X3 128 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.37■□□□□ 0.05
RABGGTA-208ENST00000558954 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms