RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 MDP1Q86V88 176 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 GAPTQ8N292 157 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 PRSS50Q9UI38 385 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 A0A1B0GW64 132 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ARGFXA6NJG6 315 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 FAM74A7A6NL05 159 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 RNF212BA8MTL3 300 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 TSPAN9O75954 239 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 DFFBO76075 338 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 NGFP01138 241 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 IGHG3P01860 377 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 SCTP09683 121 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 SFTA3P0C7M3 94 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 CCL2P13500 99 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 RAC2P15153 192 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 HOXC12P31275 282 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 RAB2AP61019 212 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 PPP1CBP62140 327 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 PDCD1Q15116 288 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 GUCA2BQ16661 112 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 NMSQ5H8A3 153 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 Q6ZPA2 131 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 DMBX1Q8NFW5 382 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ERGIC1Q969X5 290 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 C12orf49Q9H741 205 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 C19orf12Q9NSK7 152 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 NCKAP5O14513 1909 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 A0A1B0GU03 582 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 HSD17B6O14756 317 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ADAM20O43506 726 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 SMPD2O60906 423 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 SERPINE2P07093 398 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ZNF44P15621 663 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 F2RP25116 425 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 CD80P33681 288 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 SNCAP37840 140 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 AKR1C2P52895 323 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ID3Q02535 119 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 AKR1C1Q04828 323 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 MZT1Q08AG7 82 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 HERPUD1Q15011 391 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 MSMO1Q15800 293 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 C3AR1Q16581 482 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 OR2T2Q6IF00 324 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 STX12Q86Y82 276 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 RAB40CQ96S21 281 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 DMDP11532 3685 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-205ENST00000546891 PRR33A8MZF0 331 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 AQP7O14520 342 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 SH2D1BO14796 132 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ZNF205O95201 554 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 HBE1P02100 147 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 OR8U9P0C7N5 309 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 CA6P23280 308 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TNFSF10P50591 281 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 ZNF616Q08AN1 781 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-205ENST00000546891 TGIF1Q15583 401 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms