RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	LTC4S	Q16873	150 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	SYS1	Q8N2H4	156 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	DRAM1	Q8N682	238 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	PXT1	Q8NFP0	134 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OR56B4	Q8NH76	319 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	DHDH	Q9UQ10	334 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	PSG11	Q9UQ72	335 aa		12.72	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM212	A6NML5	194 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ZFPL1	O95159	310 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	IL1A	P01583	271 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM11	P17152	192 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	CAPG	P40121	348 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	MADCAM1	Q13477	382 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	HNF4G	Q14541	408 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	IL13RA2	Q14627	380 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	SATL1	Q86VE3	508 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	RFESD	Q8TAC1	157 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	DPF1	Q92782	380 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	GPER1	Q99527	375 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777	C8orf4	Q9NR00	106 aa		12.71	□□□□□ -0.37
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1W2PPI3	338 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777		E9PI62	339 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	MAGEB3	O15480	346 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	FGF16	O43320	207 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	RAB3A	P20336	220 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	THBS3	P49746	956 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	GNG10	P50151	68 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	RAB7A	P51149	207 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	OR8H3	Q8N146	312 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	TFAP2C	Q92754	450 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	AMBN	Q9NP70	447 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		12.7	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	SERPINE3	A8MV23	424 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	NUDT19	A8MXV4	375 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	GABRP	O00591	440 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV1D-33	P01593	117 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV1-33	P01594	117 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC159	P0C7I6	412 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	KCNJ3	P48549	501 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	RSU1	Q15404	277 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	PIGY	Q3MUY2	71 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	ZFP57	Q9NU63	452 aa		12.69	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1W2PPE3	182 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	HTR3B	O95264	441 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	MYCNOS	P40205	109 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	SOX2	P48431	317 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	SLC35B1	P78383	322 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	PAX5	Q02548	391 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	TTC23	Q5W5X9	447 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF529	Q6P280	563 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777		Q8NFD4	153 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777		Q96MT0	163 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		12.68	□□□□□ -0.38
DDX11-222	ENST00000542777	MPZL2	O60487	215 aa		12.67	□□□□□ -0.38

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