RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 Q6ZTK2 550 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 COQ2Q96H96 371 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 BEX2Q9BXY8 128 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ETAA1Q9NY74 926 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR6C3Q9NZP0 311 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 SPATA2Q9UM82 520 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ODAMA1E959 279 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 UBE2QL1A1L167 161 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 INAFM1C9JVW0 142 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 M0R1W7 72 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 UPK1BO75841 260 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 SCGNO76038 276 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 AVPP01185 164 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF728P0DKX0 622 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 CHATP28329 748 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM50BP56557 158 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 PLA2G7Q13093 441 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 Q6ZNX1 250 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 MFSD4AQ8N468 514 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 NANPQ8TBE9 248 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 CORO2AQ92828 525 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 PHF21AQ96BD5 680 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 RAB3CQ96E17 227 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF714Q96N38 554 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 PCGF1Q9BSM1 259 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 OPN4Q9UHM6 478 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 KIF25Q9UIL4 384 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 HSF4Q9ULV5 492 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZANQ9Y493 2812 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ACANP16112 2415 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 J3QRK9 145 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 RAB27BO00194 218 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 PTTG1O95997 202 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 MT-ND4P03905 459 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 MMP9P14780 707 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCL3L1P16619 93 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 GZMHP20718 246 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF273Q14593 569 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ARL6IP1Q15041 203 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 SETD6Q8TBK2 473 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 UPRTQ96BW1 309 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 SULT4A1Q9BR01 284 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 PECRQ9BY49 303 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 SIRPDQ9H106 197 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 TAS2R3Q9NYW6 316 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 MED13LQ71F56 2210 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 C17orf98A8MV24 154 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 HAX1O00165 279 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 PRTN3P24158 256 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 MOGAT2Q3SYC2 334 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCDC190Q86UF4 302 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 Q8N7P7 452 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCDC107Q8WV48 283 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 TBX15Q96SF7 602 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 DIABLOQ9NR28 239 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 A0A0A6YYH2 397 aa9.22□□□□□ -0.93
TRAPPC4-211ENST00000533012 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.22□□□□□ -0.93
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