RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GUSBP1Q15486 140 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDNFQ49AH0 187 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM42Q69YG0 159 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10K2Q6IF99 312 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TPGS1Q6ZTW0 290 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C7orf65Q6ZTY9 151 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RUFY3Q7L099 469 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR11H6Q8NGC7 330 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANGPTL6Q8NI99 470 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCGB1C1Q8TD33 95 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TWIST2Q8WVJ9 160 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM234Q8WY98 164 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ING5Q8WYH8 240 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FMC1Q96HJ9 113 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANAPC13Q9BS18 74 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HPF1Q9NWY4 346 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PITPNC1Q9UKF7 332 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALPK2Q86TB3 2170 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MIA3Q5JRA6 1907 aa-0.87□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1B0GXF2 115 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2AG2A6NM03 316 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD300LBA8K4G0 201 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C2orf74A8MZ97 194 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 E7EWF7 191 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 H0YCG3 227 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC17A3O00476 420 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GUCA1CO95843 209 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RLN2P04090 185 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FGF4P08620 206 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BPIFB3P59826 476 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTR1AP61163 376 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DEFA6Q01524 100 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BSPH1Q075Z2 132 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAJINQ3KP22 176 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALKBH6Q3KRA9 238 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C10orf55Q5SWW7 151 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GABRG1Q8N1C3 465 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR11H1Q8NG94 326 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6K3Q8NGY3 331 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C22orf15Q8WYQ4 148 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NRGNQ92686 78 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CENPKQ9BS16 269 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM70Q9BUB7 260 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf1Q9H5F2 150 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TFR2Q9UP52 801 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WASHC3Q9Y3C0 194 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNURFQ9Y675 71 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALPK3Q96L96 1907 aa-0.88□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARAP3Q8WWN8 1544 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEIKINA0A087WXM9 373 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARGFXA6NJG6 315 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOR1AO14656 332 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHYHO14832 338 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COCHO43405 550 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TCF21O43680 179 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MPDU1O75352 247 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR2F2O95006 317 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LTAP01374 205 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFNW1P05000 195 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC2A3P11169 496 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GFAPP14136 432 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDGFRLQ15198 375 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRAMEF20Q5VT98 475 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RASL11AQ6T310 242 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIF2BQ8N4N8 673 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF565Q8N9K5 539 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR56B2PQ8NGI1 322 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4P4Q8NGL7 312 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10A6Q8NH74 314 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITFG1Q8TB96 612 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MBD3L1Q8WWY6 194 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C8orf44Q96CB5 159 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMELYQ99218 206 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CST9LQ9H4G1 147 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MCUBQ9NWR8 336 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D24Q9ULP9 559 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SBNO1A3KN83 1393 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KANK1Q14678 1352 aa-0.89□□□□□ -2.55
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNA1CQ13936 2221 aa-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms