RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 MELTFP08582 738 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 FBP1P09467 338 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SMIM18P0DKX4 95 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARSBP15848 533 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 DLX1P56177 255 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SCN1BQ07699 218 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 NEDD8Q15843 81 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAF9Q16594 264 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.75□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.75□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 KIRREL1Q96J84 757 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 MDFIQ99750 246 aa6.75□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 KCNK15Q9H427 330 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 BANF2Q9H503 90 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A0A6YYD4 124 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 VGLL3A8MV65 326 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRIM77I1YAP6 450 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 MMP23AO75900 390 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 MPIG6BO95866 241 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGLV1-47P01700 117 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 CD36P16671 472 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB3BP20337 219 aa6.74□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 GADD45AP24522 165 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SSTR5P35346 364 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 GLP1RP43220 463 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 IER3P46695 156 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SCAND1P57086 179 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR10A3P58181 314 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.74□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR52W1Q6IF63 320 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.74□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.74□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM46BQ96A09 425 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 PTX4Q96A99 478 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.74□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 CALYQ9NYX4 217 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 HSF4Q9ULV5 492 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 SSR3Q9UNL2 185 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.73□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM127O75204 238 aa6.73□□□□□ -1.33
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TRAPPC3-206ENST00000469757 CDK2P24941 298 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 GDNFP39905 211 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 DYNLT3P51808 116 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 BAMBIQ13145 260 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 P2RY14Q15391 338 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q3ZCU0 254 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.73□□□□□ -1.33
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