RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465627.5

UBA3-208, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 3, human

TSL 2

Gene UBA3, Length 1,388 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBA3-208	ENST00000465627	FAM201A	Q5SY85	155 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	UPRT	Q96BW1	309 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	SDSL	Q96GA7	329 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	SLC6A7	Q99884	636 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	TMEM165	Q9HC07	324 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627		Q9N2K0	584 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	NLK	Q9UBE8	527 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	NPTN	Q9Y639	398 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23	2e-6	■■■■■ 38.3
UBA3-208	ENST00000465627	HIVEP2	P31629	2446 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		7.35	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	OR2AT4	A6NND4	320 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627		M0QYG6	137 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	OVOL3	O00110	214 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	SH2D1B	O14796	132 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	FCER2	P06734	321 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	GIF	P27352	417 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	PRDX2	P32119	198 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	CD80	P33681	288 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	CCR6	P51684	374 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	BEST4	Q8NFU0	473 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	OR56B4	Q8NH76	319 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	RDH5	Q92781	318 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	COQ2	Q96H96	371 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	MMP28	Q9H239	520 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	LIME1	Q9H400	295 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	DECR2	Q9NUI1	292 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	ZNF221	Q9UK13	617 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	EDAR	Q9UNE0	448 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBA3-208	ENST00000465627	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	LGALS8	O00214	317 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	SIRPB1	O00241	398 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	NDUFB6	O95139	128 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	RAB3D	O95716	219 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	TCRB	P04435	133 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	HEXA	P06865	529 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	HLA-DMA	P28067	261 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	HRH1	P35367	487 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	KCNJ3	P48549	501 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	INPP1	P49441	399 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	RAG2	P55895	527 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	GMFB	P60983	142 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	COL10A1	Q03692	680 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	MEF2D	Q14814	521 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	HERPUD1	Q15011	391 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	CR1L	Q2VPA4	569 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	ACTBL2	Q562R1	376 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	AGAP6	Q5VW22	663 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	OR4K15	Q8NH41	348 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	C14orf79	Q96F83	325 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	GAFA1	Q96PS6	74 aa		7.33	□□□□□ -1.24
UBA3-208	ENST00000465627	FOXC2	Q99958	501 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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