RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SOSTQ9BQB4 213 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GHRLQ9UBU3 117 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR14J1Q9UGF5 321 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 F8W036 122 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SH2D1BO14796 132 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SDC2P34741 201 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 AWAT2Q6E213 333 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR8H3Q8N146 312 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ST8SIA4Q92187 359 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM186Q96B77 213 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 MCUBQ9NWR8 336 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 V9GY05 133 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 LOC105371242A0A075B767 164 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 LYRM1O43325 122 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 HAND1O96004 215 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 UBBP0CG47 229 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CALCBP10092 127 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CAPZA1P52907 286 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TPRA1Q86W33 373 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 KCTD7Q96MP8 289 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GW55 424 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC17A2O00624 439 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TFF1P04155 84 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DUX4L2P0CJ85 424 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DUX4L3P0CJ86 424 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DUX4L4P0CJ87 422 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DUX4L5P0CJ88 424 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DUX4L6P0CJ89 424 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DUX4L7P0CJ90 424 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GTF2F2P13984 249 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GATA3P23771 443 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 HTR2CP28335 458 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CAV3P56539 151 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 COL10A1Q03692 680 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 IL13RA2Q14627 380 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OSR2Q8N2R0 312 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 UPRTQ96BW1 309 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GFI1Q99684 422 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 IL36RNQ9UBH0 155 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DUX4Q9UBX2 424 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 COL6A5A8TX70 2615 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB3BP20337 219 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SERPINA2P20848 420 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DUSP1P28562 367 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB11BQ15907 218 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00596Q86U02 117 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 CHST4Q8NCG5 386 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX22Q96L94 193 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 C12orf57Q99622 126 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 ATRQ13535 2644 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SHISA3A0PJX4 238 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 K7N7A8 449 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DEGS1O15121 323 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 FCN3O75636 299 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 SELLP14151 372 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFB7P17568 137 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 LMO1P25800 156 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 BTN1A1Q13410 526 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM209BQ5JX69 171 aa8.78□□□□□ -1
RABGEF1-205ENST00000450873 DCAF12L2Q5VW00 463 aa8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms