RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 UTF1Q5T230 341 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRTM1Q86UE6 522 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTN4RL2Q86UN3 420 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD12Q8N2K0 398 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 UQCC2Q9BRT2 126 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALYQ9NYX4 217 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF114Q9Y508 228 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A087X0M5 115 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GX30 115 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV1-47P01700 117 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSMCR30P0CW71 290 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROK1P58294 105 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIAT1Q6ZQX7 453 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM104Q8NE00 496 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGMS2Q8NHU3 365 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDNFQ8TB73 568 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRGPRDQ8TDS7 321 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHYHIPQ92561 330 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIRREL1Q96J84 757 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCF19Q9Y242 345 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 HILPDAQ9Y5L2 63 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL1AP01583 271 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 UCHL1P09936 223 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGMTP16455 207 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTR1DP28221 377 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB13P51153 203 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYNLT3P51808 116 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTAP10-3P60369 221 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS25P62851 125 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATAD3CQ5T2N8 411 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35E4Q6ICL7 350 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEACAM19Q7Z692 300 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM203Q969S6 136 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 BANF2Q9H503 90 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00574Q9H8X3 128 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPEP16870 476 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSTR5P35346 364 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRICD5Q6PL45 260 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM91Q6ZNR0 172 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF565Q8N9K5 539 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF596Q8TC21 504 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q96M66 194 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB18Q9NP72 206 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 A6NDX4 124 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFYBP25208 207 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-DRB5Q30154 266 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf100Q5SVJ3 147 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEK7Q8TDX7 302 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYYR1Q96J86 154 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGLLQ99685 303 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 CITED1Q99966 193 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPACA1Q9HBV2 294 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPM3Q9P2X0 92 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A10PA6NDY2 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A18PA6NE21 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A16PA6NEW6 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A7PA6NKC0 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A22PA8MWA6 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A12PA8MX19 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 F2RL2O00254 374 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A15PP0C7V4 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A13PP0C7W8 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A14PP0C7W9 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM90A24PP0C7X0 464 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRMP19623 302 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR31Q5SQ13 230 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLT8D1Q68CQ7 371 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB12Q6IQ22 244 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF367Q7RTV3 350 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM219Q86XT9 240 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4C13Q8NGP0 309 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFESDQ8TAC1 157 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM46BQ96A09 425 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 GHRLQ9UBU3 117 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBBP0CG47 229 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD37P11049 281 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms