RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A8Q9NY64 477 aa18.52■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TTRP02766 147 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 CAMPP49913 170 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD55Q3KP44 614 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 IL22RA2Q969J5 263 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 RSRP1Q9BUV0 290 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TINAGQ9UJW2 476 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 VSIG4Q9Y279 399 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA5P43359 124 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB124Q8NES8 71 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PRNDQ9UKY0 176 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 CBY3A6NI87 242 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 FAM74A7A6NL05 159 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 NEURL1O76050 574 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PIGYQ3MUY2 71 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SMDT1Q9H4I9 107 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 FBLIM1Q8WUP2 373 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 OR10C1Q96KK4 312 aa18.51■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PDE6DO43924 150 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ERGP11308 486 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 G0S2P27469 103 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 VAX1Q5SQQ9 334 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A13Q7RTY0 426 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 OR52L2PQ8NGH6 319 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 MRGPRFQ96AM1 343 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 GHITMQ9H3K2 345 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM210A6NLX4 147 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-13P01766 116 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-7P01780 117 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 LYZP61626 148 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TNXAQ16473 311 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF596Q8TC21 504 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ZPLD1Q8TCW7 415 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SPAG17Q6Q759 2223 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF253O75346 499 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ABHD3Q8WU67 409 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 RAB1BQ9H0U4 201 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQF6 199 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 DPPA3Q6W0C5 159 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 KLK13Q9UKR3 277 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1D-16P01601 117 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PGA4P0DJD7 388 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PGA5P0DJD9 388 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 DAOP14920 347 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PSG5Q15238 335 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 FAM87AP0C7U9 286 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 RNF122Q9H9V4 155 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0U1RQV5 110 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 H3BQ15 152 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 FAM117AQ9C073 453 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 RNF7Q9UBF6 113 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 NCMAPQ5T1S8 102 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 FAM27BQ5VT28 67 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM50BP56557 158 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM97Q5BJF2 176 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 OR4P4Q8NGL7 312 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TMPRSS2O15393 492 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 OR4A8P0C604 315 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 OR1B1Q8NGR6 318 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 BET1LQ9NYM9 111 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 IFI6P09912 130 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PGLYRP3Q96LB9 341 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DQB1P01920 261 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 CD3EP07766 207 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 LHFPL5Q8TAF8 219 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ELOBQ15370 118 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 KHDC3LQ587J8 217 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 LRP11Q86VZ4 500 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM191AQ9H0A3 160 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC13O75165 2243 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 BMPR1BO00238 502 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 RBM11P57052 281 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-DRB5Q30154 266 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PLPPR5Q32ZL2 321 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 STXBP6Q8NFX7 210 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A18H0YCH9 400 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 M0R143 59 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 C1QCP02747 245 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V0CP27449 155 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A18Q3C1V0 323 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 FBXW9Q5XUX1 488 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 SLC23A3Q6PIS1 610 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T8A6NH00 312 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.9 ms