RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598539.5

FCHO1-225, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-225ENST00000598539 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 C11orf88Q6PI97 169 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 ZNF788Q6ZQV5 615 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 LYPD6Q86Y78 171 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 LDLRAD3Q86YD5 345 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 OSR2Q8N2R0 312 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 Q8NFD4 153 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 OR51T1Q8NGJ9 327 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 RAB2BQ8WUD1 216 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 GAFA1Q96PS6 74 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SPACA1Q9HBV2 294 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 OR14J1Q9UGF5 321 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 STEAP1Q9UHE8 339 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 ING4Q9UNL4 249 aa10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 RYR3Q15413 4870 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 RFPL4AA6NLU0 287 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SH2D1BO14796 132 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 HTR3BO95264 441 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 IL1AP01583 271 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 IGHV1-69P01742 117 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SFTPBP07988 381 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 CD37P11049 281 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 IER3P46695 156 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 NPBWR2P48146 333 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 CAV3P56539 151 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 RBM11P57052 281 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SCAND1P57086 179 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 HERPUD1Q15011 391 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 Q6ZSV7 163 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 DTX3Q8N9I9 347 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 C19orf18Q8NEA5 215 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM185AQ8NFB2 350 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 OR4D6Q8NGJ1 314 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 KCNG3Q8TAE7 436 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 CENPOQ9BU64 300 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM59Q9BXS4 323 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.61□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 FUOMA2VDF0 154 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 IFITM5A6NNB3 132 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 TSPAN9O75954 239 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 CDRT1O95170 752 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 IGHV4-59P01825 116 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 FBP1P09467 338 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 ARSBP15848 533 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 MGMTP16455 207 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 PRDX2P32119 198 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 KCNJ3P48549 501 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 IKZF1Q13422 519 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SFXN4Q6P4A7 337 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 BATF2Q8N1L9 274 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 FAM216BQ8N7L0 139 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 ST8SIA4Q92187 359 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 WDFY2Q96P53 400 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 CCL13Q99616 98 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 IFT22Q9H7X7 185 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 CTSZQ9UBR2 303 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 FBLN5Q9UBX5 448 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 VPREB3Q9UKI3 123 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 ST3GAL6Q9Y274 331 aa10.6□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SCGNO76038 276 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 ZNF44P15621 663 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SDC2P34741 201 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SERPINB10P48595 397 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 TMBIM6P55061 237 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SNU13P55769 128 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 GPR107Q5VW38 600 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 RNF144BQ7Z419 303 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 OR4S1Q8NGB4 309 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 OR5D13Q8NGL4 314 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 OR10K1Q8NGX5 313 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SEH1LQ96EE3 360 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 SNX22Q96L94 193 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 GFI1Q99684 422 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 ETV7Q9Y603 341 aa10.59□□□□□ -0.71
FCHO1-225ENST00000598539 A0A1W2PPH5 198 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 SHISA3A0PJX4 238 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 TMEM14DPA8MWL7 114 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 F8VVB4 439 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 F8VWA3 439 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 DVL1O14640 695 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 MPIG6BO95866 241 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 OR2H2O95918 312 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 CSN2P05814 226 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 NDUFB7P17568 137 aa10.58□□□□□ -0.72
FCHO1-225ENST00000598539 GABRR1P24046 479 aa10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms