RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF580Q9UK33 172 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 VSIG4Q9Y279 399 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A1W2PPE3 182 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC25A17O43808 307 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 IGLV1-40P01703 118 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 CSN2P05814 226 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 CCL1P22362 96 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 CNTFRP26992 372 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 GNG10P50151 68 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 RAB9AP51151 201 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 F2RL1P55085 397 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 ODF4Q2M2E3 257 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 Q6P435 159 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 DDB2Q92466 427 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 ARPC1AQ92747 370 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 BORCS8Q96FH0 119 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 MNTQ99583 582 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 APOL4Q9BPW4 351 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 OR51J1Q9H342 316 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 GHITMQ9H3K2 345 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 RETNQ9HD89 108 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 R4GMQ9 66 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 LINC01619G3V211 115 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 G3V318 75 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 H3BN98 237 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 HSD17B6O14756 317 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 ARPC2O15144 300 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 HSPA12AO43301 675 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 LY6G6CO95867 125 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 IGKV1D-12P01611 117 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 OR8U9P0C7N5 309 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 HSD17B1P14061 328 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 HTR1FP30939 366 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 SOX6P35712 828 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGGTA-217ENST00000560521 KIR3DL2P43630 455 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 REG1BP48304 166 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGGTA-217ENST00000560521 APOFQ13790 326 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 GINS1Q14691 196 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM65Q6PI78 240 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGGTA-217ENST00000560521 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 RFESDQ8TAC1 157 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 EME1Q96AY2 570 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 NABP2Q9BQ15 211 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 CHST5Q9GZS9 411 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 CALYQ9NYX4 217 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGGTA-217ENST00000560521 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGGTA-217ENST00000560521 A0A087WW49 117 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 CCDC182A6NF36 153 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 CYB5AP00167 134 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 MOSP00540 346 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 IGLV1-51P01701 117 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 OR5H8P0DN80 308 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF44P15621 663 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 ARSBP15848 533 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 CD1BP29016 333 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 RBP2P50120 134 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 ATP1B3P54709 279 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTA-217ENST00000560521 CXCR4P61073 352 aa6.86□□□□□ -1.31
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