RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 TLE4Q04727 773 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ZNF846Q147U1 533 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ARL6IP1Q15041 203 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 P2RY14Q15391 338 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 RSU1Q15404 277 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 C10orf25Q5T742 122 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 RAB12Q6IQ22 244 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 Q8IYB0 196 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PXT1Q8NFP0 134 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PTX4Q96A99 478 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 C14orf79Q96F83 325 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PKIBQ9C010 78 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 RHOFQ9HBH0 211 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 GLS2Q9UI32 602 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 A0A0A6YYH2 397 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 LRP5LA4QPB2 252 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 FABP12A6NFH5 140 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 A6NJ64 397 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CLDN25C9JDP6 229 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 M0R233 179 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 TPPPO94811 219 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CD37P11049 281 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 GTF2F2P13984 249 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 IRF2P14316 349 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ALDH3B1P43353 468 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 HAAOP46952 286 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 POU3F4P49335 361 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 TNK1Q13470 666 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 AGAP6Q5VW22 663 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR51F2Q8NH61 342 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ERGIC1Q969X5 290 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 FAM46BQ96A09 425 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PERPQ96FX8 193 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 WDFY2Q96P53 400 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SPACA5Q96QH8 159 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 GHITMQ9H3K2 345 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 DECR2Q9NUI1 292 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 STAB1Q9NY15 2570 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 LRRC30A6NM36 301 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 A6NNC1 897 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SHISA9B4DS77 424 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 J3QT63 122 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 IFNL4K9M1U5 179 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CTDSP2O14595 271 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 SPRY3O43610 288 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 HPGDSO60760 199 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PAGE4O60829 102 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PAHP00439 452 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 IFNA2P01563 188 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CD200P41217 278 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 MNDAP41218 407 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 NR4A2P43354 598 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 OR3A4PP47883 348 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 PITPNBP48739 271 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 CLDN12P56749 244 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 IL24Q13007 206 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 IL18Q14116 193 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 EFNB3Q15768 340 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-210ENST00000512194 ADIPOQQ15848 244 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms