RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 MOB1BQ7L9L4 216 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF720Q7Z2F6 126 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 GRINAQ7Z429 371 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 UNC93AQ86WB7 457 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RAB43Q86YS6 212 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CBWD2Q8IUF1 395 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RDH10Q8IZV5 341 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PGAM4Q8N0Y7 254 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 GABRG1Q8N1C3 465 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF283Q8N7M2 679 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CLDN22Q8N7P3 220 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PXT1Q8NFP0 134 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR2M7Q8NG81 312 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR56A4Q8NGH8 313 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CD200R1Q8TD46 325 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM239Q8WW34 195 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 C11orf40Q8WZ69 217 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TM4SF19Q96DZ7 209 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 VAT1Q99536 393 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RBBP8Q99708 897 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 EBF4Q9BQW3 602 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TIMM29Q9BSF4 260 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 C20orf24Q9BUV8 137 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TM2D1Q9BX74 207 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 DUSP16Q9BY84 665 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 HES7Q9BYE0 225 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 MIXL1Q9H2W2 232 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CALHM2Q9HA72 323 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PHF11Q9UIL8 331 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ARL5AQ9Y689 179 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ABCA1O95477 2261 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 GJE1A6NN92 205 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 C9J4A7 227 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 H3BNH8 94 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 I3L521 148 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 M0QXV9 152 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CXCR6O00574 342 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RFXANKO14593 260 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 XRCC2O43543 280 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SLC19A2O60779 497 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RAMP1O60894 148 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ENTPD5O75356 428 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SPAG7O75391 227 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RP2O75695 350 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR2J2O76002 312 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 C2P06681 752 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SERPINE2P07093 398 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SDC1P18827 310 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SERPINA2P20848 420 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 STOMP27105 288 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 AK4P27144 223 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 HTR2AP28223 471 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 CASP1P29466 404 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 GNRHRP30968 328 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 FMO3P31513 532 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SLC6A8P48029 635 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 NPBWR2P48146 333 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RFX3P48380 749 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 GFERP55789 205 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TFF3Q07654 80 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 APOFQ13790 326 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RAB35Q15286 201 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TRIP10Q15642 601 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ADPRMQ3LIE5 342 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SLC36A2Q495M3 483 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SPIN3Q5JUX0 258 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SYPL2Q5VXT5 272 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SLC16A13Q7RTY0 426 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 DPY19L4Q7Z388 723 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 WDFY1Q8IWB7 410 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 OR13D1Q8NGV5 346 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 COQ8AQ8NI60 647 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 NUBPLQ8TB37 319 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 M1APQ8TC57 530 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 TMEM234Q8WY98 164 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF799Q96GE5 643 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 SFRP2Q96HF1 295 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 PHB2Q99623 299 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms