RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 ERVFRD-1P60508 538 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 RPS25P62851 125 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PAX5Q02548 391 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 GRK1Q15835 563 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 SSX1Q16384 188 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PIGYQ3MUY2 71 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 Q6YL49 198 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 Q8N1Y9 231 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 CHST4Q8NCG5 386 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 UFD1Q92890 307 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 COQ2Q96H96 371 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 AJUBAQ96IF1 538 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 MGLLQ99685 303 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 TMED9Q9BVK6 235 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 PPA2Q9H2U2 334 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 Q9H521 79 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 IFT22Q9H7X7 185 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 CKLFQ9UBR5 152 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGB1-217ENST00000494395 A0A0U1RQK1 487 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 NPFFO15130 113 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 HSMCR30P0CW71 290 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF728P0DKX0 622 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF44P15621 663 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 GABRR1P24046 479 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 GLIPR1P48060 266 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 P2RX3P56373 397 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 EDDM3BP56851 147 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 EDDM3AQ14507 147 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 RSU1Q15404 277 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 TMEM177Q53S58 311 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 UBE2UQ5VVX9 321 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 NCR3LG1Q68D85 454 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 OSR2Q8N2R0 312 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 PNKDQ8N490 385 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 PHYHIPQ92561 330 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 CORO2AQ92828 525 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 MUL1Q969V5 352 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 DUX5Q96PT3 197 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 GFI1Q99684 422 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 METTL9Q9H1A3 318 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 GLS2Q9UI32 602 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 A0A1W2PPH5 198 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 hADV38S2A0JD32 116 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 NOTOA8MTQ0 251 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 ODF3BA8MYP8 253 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 TRIM77I1YAP6 450 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 DEGS1O15121 323 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 MMP23AO75900 390 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 MELTFP08582 738 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 CGB3P0DN86 165 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 CGB7P0DN87 165 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 SRMP19623 302 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 SERPINA2P20848 420 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 GABRA5P31644 462 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 SAA4P35542 130 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 FABP5Q01469 135 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 AESQ08117 197 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 BLMHQ13867 455 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 KIR3DS1Q14943 382 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 TRAM1Q15629 374 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 LINC00596Q86U02 117 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 SPARTQ8N0X7 666 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 C17orf50Q8WW18 174 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 TMEM203Q969S6 136 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 ZNF714Q96N38 554 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGB1-217ENST00000494395 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms