RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		Q6ZS49	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		A0A1W2PP11	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ODAM	A1E959	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		H3BMQ9	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	XRCC3	O43542	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MPIG6B	O95866	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	LY6G6D	O95868	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF44	P15621	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SERPINA2	P20848	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GABRR1	P24046	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DUSP1	P28562	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CD34	P28906	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SOX6	P35712	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	VBP1	P61758	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	NCS1	P62166	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	LCN2	P80188	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PITPNA	Q00169	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	IKZF1	Q13422	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GRK1	Q15835	563 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR52W1	Q6IF63	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		Q6ZTK2	550 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	COQ2	Q96H96	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	BANF2	Q9H503	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	METRN	Q9UJH8	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ATR	Q13535	2644 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DYSF	O75923	2080 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		A0A0A6YYD4	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		A0A1B0GW55	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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