RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456467.1

SIX3-AS1-202, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 557 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PDZK1IP1Q13113 114 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MADCAM1Q13477 382 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CATSPERDQ86XM0 798 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SLC35F2Q8IXU6 374 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 Q8N1Y9 231 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CHST5Q9GZS9 411 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ARL8BQ9NVJ2 186 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa10.13□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FUOMA2VDF0 154 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MAGEA13PA6NCF6 341 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 I3L521 148 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PRKYO43930 277 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SAP30O75446 220 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF44P15621 663 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 F2RL1P55085 397 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SPIN3Q5JUX0 258 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF429Q86V71 674 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 Q8IYB0 196 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PRSS35Q8N3Z0 413 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF491Q8N8L2 437 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CCDC197Q8NCU1 140 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ISOC1Q96CN7 298 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KCTD7Q96MP8 289 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SPACA5Q96QH8 159 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TBX5Q99593 518 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MAGIXQ9H6Y5 334 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MOB1AQ9H8S9 216 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PLEKHA1Q9HB21 404 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ADGRL4Q9HBW9 690 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ISYNA1Q9NPH2 558 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CALYQ9NYX4 217 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KIF25Q9UIL4 384 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 WSB1Q9Y6I7 421 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HERC2O95714 4834 aa10.12□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TNCP24821 2201 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 G3V318 75 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HSPB6O14558 160 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DEGS1O15121 323 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LDLRAD4O15165 306 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GATBO75879 557 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SERPINA3P01011 423 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ATF1P18846 271 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HTR1FP30939 366 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 VEGFCP49767 419 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RAB7AP51149 207 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SLURP1P55000 103 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CDK5R1Q15078 307 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 OR8H3Q8N146 312 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 OR5D18Q8NGL1 313 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FGGYQ96C11 551 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 S1PR3Q99500 378 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GON7Q9BXV9 100 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 COMMD4Q9H0A8 199 aa10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MEIKINA0A087WXM9 373 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 OVOL1O14753 267 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KDM4BO94953 1096 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CYB5AP00167 134 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CST1P01037 141 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 OR8U8P0C7N1 319 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GLP1RP43220 463 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF616Q08AN1 781 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BNIP1Q12981 228 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DNAAF1Q8NEP3 725 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MRGPRDQ8TDS7 321 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ADI1Q9BV57 179 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SLC25A19Q9HC21 320 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 C19orf73Q9NVV2 129 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 OR6C3Q9NZP0 311 aa10.1□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa10.09□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HSD17B6O14756 317 aa10.09□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MPZL2O60487 215 aa10.09□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CSN2P05814 226 aa10.09□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 VDAC1P21796 283 aa10.09□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PPIFP30405 207 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KIR3DL2P43630 455 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms