RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A7PA6NKC0 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A22PA8MWA6 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A12PA8MX19 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A1O15245 554 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A15PP0C7V4 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A13PP0C7W8 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A14PP0C7W9 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM90A24PP0C7X0 464 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 IGHV1-8P0DP01 117 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 RANBP1P43487 201 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 UBA52P62987 128 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 KLRD1Q13241 179 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM86BQ8N661 226 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SUMF2Q8NBJ7 301 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 C19orf24Q9BVV8 132 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM96BQ9Y3D0 163 aa13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0U1RQK1 487 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MGMTP16455 207 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CALRP27797 417 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PSMB9P28065 219 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 HTR2CP28335 458 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC9A3R2Q15599 337 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TAF9Q16594 264 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 LDLRAD3Q86YD5 345 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF565Q8N9K5 539 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM104Q8NE00 496 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 OR6M1Q8NGM8 313 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SPATA3Q8NHX4 192 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CST11Q9H112 138 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GLAP06280 429 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MELTFP08582 738 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FBP1P09467 338 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CGB3P0DN86 165 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CGB7P0DN87 165 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SAA4P35542 130 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC35E4Q6ICL7 350 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 HEPN1Q6WQI6 88 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 OR11H6Q8NGC7 330 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNG3Q8TAE7 436 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A28Q96A46 364 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 Q96M66 194 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SELENOIQ9C0D9 397 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 BANF2Q9H503 90 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 POMT1Q9Y6A1 747 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SESN1Q9Y6P5 492 aa13.74□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PRD5 423 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PRF3 423 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PRM7 423 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MEIOCA2RUB1 952 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC17A2O00624 439 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 HSPB6O14558 160 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 BPNT1O95861 308 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 VSIG8P0DPA2 414 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 QRFPP83859 136 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ATAD3CQ5T2N8 411 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52W1Q6IF63 320 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PNKDQ8N490 385 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 SSMEM1Q8WWF3 244 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GFI1Q99684 422 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00574Q9H8X3 128 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF581Q9P0T4 197 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF25Q9UIL4 384 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 V9GY05 133 aa13.73□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MEIKINA0A087WXM9 373 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM14DPA8MWL7 114 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 MCRIP1C9JLW8 97 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PDCD5O14737 125 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CA11O75493 328 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CLPXO76031 633 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFAIP8O95379 198 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 GZMHP20718 246 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 FUT3P21217 361 aa13.72□□□□□ -0.21
RABGEF1-204ENST00000442563 IER3P46695 156 aa13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms