RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391087.1

RNU6-1275P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1275, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1275P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KDELC1Q6UW63 502 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR4Q2P0C623 313 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ETV6P41212 452 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SSR4P51571 173 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SCGB1D4Q6XE38 83 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR8J1Q8NGP2 316 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR51V1Q9H2C8 321 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 A0A1W2PRD5 423 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 A0A1W2PRF3 423 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 A0A1W2PRM7 423 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 A4D1N5 150 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TMEM212A6NML5 194 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GPR31O00270 319 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TCF21O43680 179 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR1F1O43749 312 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR2J3O76001 311 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NEBLO76041 1014 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TAF8Q7Z7C8 310 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF619Q8N2I2 560 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR4D5Q8NGN0 318 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR10AC1Q8NH08 325 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MUCL1Q96DR8 90 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NRBF2Q96F24 287 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 COQ2Q96H96 371 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MEAF6Q9HAF1 191 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NRCAMQ92823 1304 aa-3.95□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SMC2O95347 1197 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MYL9P24844 172 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RPL28P46779 137 aaKnown RBP-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NUCB2P80303 420 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PJVKQ0ZLH3 352 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MFSD4BQ5TF39 518 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 IYDQ6PHW0 289 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 C12orf54Q6X4T0 127 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 YIPF7Q8N8F6 280 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR5L1Q8NGL2 311 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CMBLQ96DG6 245 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 VAPAQ9P0L0 249 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-3.96□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCL25O15444 150 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 P4HA2O15460 535 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UBBP0CG47 229 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZNF728P0DKX0 622 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 GABRA6Q16445 453 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CCDC70Q6NSX1 233 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM231DQ6ZW35 169 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 EEF2KMTQ96G04 330 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NDEL1Q9GZM8 345 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HEBP1Q9NRV9 189 aa-3.97□□□□□ -3.04
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-3.97□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-3.97□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 BTN3A3O00478 584 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TOR1AO14656 332 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR2A4O95047 310 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SOX14O95416 240 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PDK4Q16654 411 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PRNTQ86SH4 94 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TRIML2Q8N7C3 387 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR10A6Q8NH74 314 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PIBF1Q8WXW3 757 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 OR2A7Q96R45 310 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 TEAD3Q99594 435 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PRSS27Q9BQR3 290 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 NIPAL2Q9H841 368 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 FAM215AQ9Y5M1 114 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa-3.98□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HYPMO75409 117 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CLPXO76031 633 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 LY6G6CO95867 125 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HSMCR30P0CW71 290 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 SLC35A2P78381 396 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 WDR88Q6ZMY6 472 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 CYP4Z1Q86W10 505 aa-3.99□□□□□ -3.05
RNU6-1275P-201ENST00000391087 RNF148Q8N7C7 305 aa-3.99□□□□□ -3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms