RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 DUPD1Q68J44 220 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 LAIR2Q6ISS4 152 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 GAPTQ8N292 157 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF563Q8TA94 476 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 DOK4Q8TEW6 326 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CASTOR1Q8WTX7 329 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 TWIST2Q8WVJ9 160 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 DDIT4LQ96D03 193 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 BIRC8Q96P09 236 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF251Q9BRH9 671 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 Q9BRP9 147 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 POMKQ9H5K3 350 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 WDR19Q8NEZ3 1342 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC88CQ9P219 2028 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CASC3O15234 703 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC25A20O43772 301 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 MYO1DO94832 1006 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 NAPSAO96009 420 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD8AP01732 235 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD9P21926 228 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ARR3P36575 388 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTPAP49638 278 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 C1QTNF8P60827 252 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 NIPAL1Q6NVV3 410 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLEC2AQ6UVW9 174 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 VN1R4Q7Z5H5 301 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR5T3Q8NGG3 340 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR5C1Q8NGR4 320 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 NDNFQ8TB73 568 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD200R1Q8TD46 325 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 KCTD4Q8WVF5 259 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 REEP6Q96HR9 211 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 DIABLOQ9NR28 239 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 VAPAQ9P0L0 249 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 HEY1Q9Y5J3 304 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ADAMTSL3P82987 1691 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 COL18A1P39060 1754 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 RTTNQ86VV8 2226 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0J9YX75 114 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1B0GTQ1 180 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CA2P00918 260 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC2A1P11166 492 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 GTF2H1P32780 548 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 GCLMP48507 274 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 XKP51811 444 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 EMP2P54851 167 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 IFFO1Q0D2I5 559 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 DOC2AQ14183 400 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR8G1Q15617 311 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 TAL2Q16559 108 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM201AQ5SY85 155 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 C16orf87Q6PH81 154 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 LINC00523Q86TU6 105 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 MARCH3Q86UD3 253 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 C10orf126Q8N4M7 172 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZIC4Q8N9L1 334 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ACBD4Q8NC06 268 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 BBOF1Q8ND07 529 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR52K1Q8NGK4 314 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR4X1Q8NH49 305 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 TCP10LQ8TDR4 215 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLDN23Q96B33 292 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 CPB2Q96IY4 423 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 RETNLBQ9BQ08 111 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 HSPB9Q9BQS6 159 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 BCL2L14Q9BZR8 327 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 BLZF1Q9H2G9 400 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 SMDT1Q9H4I9 107 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 RGCCQ9H4X1 137 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 TAS2R9Q9NYW1 312 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 IFNKQ9P0W0 207 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATAD5Q96QE3 1844 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-407P-201ENST00000365280 NEURL4Q96JN8 1562 aa0.37□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms