RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 PAX5Q02548 391 aa22.02■■□□□ 1.12
CRIP1-201ENST00000330233 RAB22AQ9UL26 194 aa22.02■■□□□ 1.12
CRIP1-201ENST00000330233 LINC00312Q9Y6C7 94 aa22.02■■□□□ 1.12
CRIP1-201ENST00000330233 HSPB6O14558 160 aa22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 FSHBP01225 129 aa22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 LSM3P62310 102 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 MXD1Q05195 221 aa22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 FAM189A2Q15884 450 aa22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 TPRX1Q8N7U7 411 aa22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 LIN7BQ9HAP6 207 aa22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF581Q9P0T4 197 aa22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM127O75204 238 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 GLIPR1P48060 266 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 RAB12Q6IQ22 244 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 VMO1Q7Z5L0 202 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 CROCCP3Q8IVE0 287 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 Q8N7P7 452 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 CORO2AQ92828 525 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 NEDD4LQ96PU5 975 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 TBX15Q96SF7 602 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 KCNK15Q9H427 330 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 SCOCQ9UIL1 159 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 NUP50Q9UKX7 468 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 PEX16Q9Y5Y5 336 aa22■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 SVEP1Q4LDE5 3571 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 MXRA5Q9NR99 2828 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 SMIM30A4D0T7 59 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 LDLRAD4O15165 306 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 PDCD6O75340 191 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF728P0DKX0 622 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 BPIFB3P59826 476 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF273Q14593 569 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 SFXN4Q6P4A7 337 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 NEK7Q8TDX7 302 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 COQ2Q96H96 371 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF714Q96N38 554 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 OR6C3Q9NZP0 311 aa21.99■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 ODAMA1E959 279 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 IL1AP01583 271 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 RBP4P02753 201 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC2LP0C7M8 214 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 PRTN3P24158 256 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 GPR157Q5UAW9 335 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 SIGIRRQ6IA17 410 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 SLC35E4Q6ICL7 350 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 BRICD5Q6PL45 260 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 FAM89BQ8N5H3 189 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF565Q8N9K5 539 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 PTX4Q96A99 478 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 LPAR5Q9H1C0 372 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 ING3Q9NXR8 418 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 TAS2R3Q9NYW6 316 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 DAPK2Q9UIK4 370 aa21.98■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 C17orf98A8MV24 154 aa21.97■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 CCL3L1P16619 93 aa21.97■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 RAB6AP20340 208 aa21.97■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 GPR107Q5VW38 600 aa21.97■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa21.97■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 MEIKINA0A087WXM9 373 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 CA11O75493 328 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 FPR2P25090 351 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 TGFBR1P36897 503 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 RPS19P39019 145 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 DLX6P56179 175 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 NCR3LG1Q68D85 454 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 C11orf42Q8N5U0 333 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 LHX4Q969G2 390 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 NICN1Q9BSH3 213 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 KIF25Q9UIL4 384 aa21.96■■□□□ 1.11
CRIP1-201ENST00000330233 TRAV40A0A0B4J280 105 aa21.95■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa21.95■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 SCAND1P57086 179 aa21.95■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 VBP1P61758 197 aa21.95■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 GUCA2AQ02747 115 aa21.95■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa21.95■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 OR56B1Q8NGI3 324 aa21.95■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa21.95■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 SIRT7Q9NRC8 400 aa21.95■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 ETAA1Q9NY74 926 aa21.95■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa21.94■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 METTL21EPA6NDL7 271 aa21.94■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 GABARAPO95166 117 aa21.94■■□□□ 1.1
CRIP1-201ENST00000330233 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms