RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm45711E0CXA2 391 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr466E9Q2B9 308 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm9493F6SVV1 192 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21876F6XK35 94 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Esp36G3UZD8 160 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm20696H3BJN7 74 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm21833J3QPK1 500 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm6401L7N2C0 213 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnf13O54965 381 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mef2bO55087 349 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Papss2O88428 621 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Creg1O88668 220 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CcnkO88874 554 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hoxa3P02831 443 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P03976 113 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp27P10077 819 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RrasP10833 218 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LipcP27656 510 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Agtr1bP29755 359 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc6a1P31648 599 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nkx2-2P42586 273 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Capza1P47753 286 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mapk14P47811 360 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Acta2P62737 377 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wfdc18P62810 74 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Actg2P63268 376 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 DtymkP97930 212 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr18Q0VAX9 331 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rnf133Q14B02 382 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Scand1Q2M4I6 142 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 BC030870Q3V2G4 71 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Diras2Q5PR73 199 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klf2Q60843 354 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp180Q6NZI9 655 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smarcd3Q6P9Z1 483 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Klhl9Q6ZPT1 617 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1275Q7TQY8 312 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SelenoiQ80TA1 398 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr70Q80ZX9 316 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sox21Q811W0 276 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm26558Q8BLW8 286 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr107Q8BUV8 551 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tssk5Q8C1R0 372 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxw14Q8C2Y5 466 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 4930451G09RikQ8C5G4 195 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zbtb26Q8C8S0 451 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ShfQ8CG80 238 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 LiphQ8CIV3 451 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc1a7Q8JZR4 559 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrpl48Q8JZS9 211 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lyrm4Q8K215 91 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vrk3Q8K3G5 453 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Commd1Q8K4M5 188 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Wfikkn1Q8R0S6 552 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ttc36Q8VBW8 186 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr881Q8VF63 314 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1453Q8VFX0 307 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1226Q8VGM5 310 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr1054Q8VGS7 312 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr656Q8VGX9 329 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr572Q8VGZ3 318 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp1r14aQ91VC7 147 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ncbp2Q9CQ49 156 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tspan31Q9CQ88 210 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 HypmQ9CR04 117 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pop4Q9CR08 221 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 UqcrbQ9D855 111 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 SmpxQ9DC77 85 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr938Q9EQ93 315 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 RhouQ9EQT3 261 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd200r1Q9ES57 326 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Elovl1Q9JLJ5 279 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hspb3Q9QZ57 154 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bpnt1Q9Z0S1 308 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ppp1r17Q9Z2E4 159 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 H2afb1S4R1E0 115 aa4.55□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm28557A0A087WQQ0 336 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TrdcA0A0G2JEU3 153 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 E030025P04RikA2A6V5 185 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm14085A2AWR5 660 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem229aB9EJI9 371 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm15446D3Z5Y8 553 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr750E9Q0Z1 331 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr550E9Q544 316 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Olfr251E9Q891 316 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psg20E9Q9B4 475 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr31F8VQN3 319 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm7970L7N271 213 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm8050L7N2E3 205 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm7980L7N471 213 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mesp2O08574 370 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 NgpO08692 167 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MfngO09008 321 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CideaO70302 217 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hdac3O88895 424 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lancl1O89112 399 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Chrnb1P09690 501 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GbaP17439 515 aa4.54□□□□□ -1.68
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cox4i1P19783 169 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.4 ms