RNA–Protein interactions for RNA: YOR295W

UAF30, Transcript of Subunit of UAF (upstream activation factor) complex, yeast

Gene UAF30, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UAF30	YOR295W	PPS1	P38148	807 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YHL041W	P38730	149 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	IES1	P43579	692 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	PSR2	Q07949	397 aa		4.77	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	MSS18	P08593	268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
UAF30	YOR295W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	NGG1	P32494	702 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	APN2	P38207	520 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ECM1	P39715	212 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	HOS4	P40480	1083 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YJL163C	P46996	555 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	STB4	P50104	949 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	HOL1	P53389	586 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	OMS1	Q06668	471 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YPT7	P32939	208 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YBR259W	P38338	688 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ACA1	P39970	489 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	VID28	P40547	921 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YIR042C	P40586	236 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	QRI7	P43122	407 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	IRC5	P43610	853 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YBP2	P53169	641 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	IRC13	Q08630	104 aa		4.75	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	AMA1	P50082	593 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	REC102	Q02721	264 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	TMN2	Q04562	672 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	MCM21	Q06675	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	DGR2	P32330	852 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	HXT4	P32467	576 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	PET127	P32606	800 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	BCD1	P38772	366 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YIL092W	P40497	633 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	BAP3	P41815	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YPS7	Q06325	596 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	STP4	Q07351	490 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	VHS3	Q08438	674 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	NKP1	Q12493	238 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	IME1	P21190	360 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	YHR112C	P38716	378 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	LYS9	P38999	446 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	STL1	P39932	569 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ASK10	P48361	1146 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	MCH5	Q08777	521 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	ACF2	Q12168	779 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UAF30	YOR295W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	DBF20	P32328	564 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	SDS22	P36047	338 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	EAF5	P39995	279 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	TEP1	P53916	434 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	NSE5	Q03718	556 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	HLR1	Q04429	423 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	GAD1	Q04792	585 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	ARP7	Q12406	477 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.71	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	PHO3	P24031	467 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	DUN1	P39009	513 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	YEL076C	P39971	216 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	UBC11	P52492	156 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	MTL1	P53214	551 aa		4.7	□□□□□ -1.66
UAF30	YOR295W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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