RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C YAP3P38749 330 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C NNF1P47149 201 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C IMD4P50094 524 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MPS2P53159 387 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C FYV6P53913 173 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YLR031WQ07978 186 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SGO1Q08490 590 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ICL2Q12031 575 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C VIK1Q12045 647 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RPO26P20435 155 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C PRI2P20457 528 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C UBA1P22515 1024 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SPB1P25582 841 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C NAM7P30771 971 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C AFG2P32794 780 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C SMY2P32909 740 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C UBC6P33296 250 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C XRS2P33301 854 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C DUT1P33317 147 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ATG19P35193 415 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RER2P35196 286 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ATP3P38077 311 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MAL31P38156 614 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C ALG3P38179 458 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C TYW3P53177 273 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C MDR1P53258 950 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YPL034WQ03083 165 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C YMR018WQ04364 514 aa3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C NOP6Q07623 225 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
DOA4YDR069C RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PMA2P19657 947 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RPC53P25441 422 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RPC19P28000 142 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C VPH2P32341 215 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ECM32P32644 1121 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C RIB7P33312 244 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YKR018CP36114 725 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MNN2P38069 597 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PEX18P38855 283 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SKN7P38889 622 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CCT4P39078 528 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C LYS14P40971 790 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C STB2P46679 850 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GNP1P48813 663 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GCV2P49095 1034 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SDA1P53313 767 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YGR266WP53326 701 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SQS1P53866 767 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ADA2Q02336 434 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YCG1Q06680 1035 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CSR1Q06705 408 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MCA1Q08601 432 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C HRK1Q08732 759 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C NSI1Q12457 570 aa3.34□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C VAS1P07806 1104 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TPM1P17536 199 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MRPL25P23369 157 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C AFR1P33304 620 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MIA40P36046 403 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C QNS1P38795 714 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
DOA4YDR069C PES4P39684 611 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MXR1P40029 184 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C CNN1P43618 361 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YGL176CP46945 554 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C APS3P47064 194 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C UBA2P52488 636 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C LIF1P53150 421 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TPP1Q03796 238 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MGR3Q04472 501 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C UBX5Q06682 500 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C BUG1Q12191 341 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MED4Q12343 284 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TRP2P00899 507 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C BMH1P29311 267 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SET3P36124 751 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MRX3P38172 270 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C FES1P38260 290 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MBP1P39678 833 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C HXT13P39924 564 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C SER3P40054 469 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C NPA3P47122 385 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C YGR053CP53234 283 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C HXT17P53631 564 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ARC35P53731 342 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C HXT15P54854 567 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C EEB1Q02891 456 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C HOT1Q03213 719 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C ADE13Q05911 482 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C TDA5Q06417 326 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C MCP2Q06567 569 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C OPI10Q08202 246 aa3.33□□□□□ -1.88
DOA4YDR069C GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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