RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 NCOA7Q8NI08 942 aa21.82■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 RGL2O15211 777 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 PI16Q6UXB8 463 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 SPATA32Q96LK8 384 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 PHKA1P46020 1223 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 RESTQ13127 1097 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 TTC6Q86TZ1 520 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 CFAP45Q9UL16 551 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 FOXP2O15409 715 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 DTNBO60941 627 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 NTSR2O95665 410 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 TRDNQ13061 729 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 DDX11Q96FC9 970 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 ATL3Q6DD88 541 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 A0A0G2JLW4 131 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 PRC1O43663 620 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 PDE6AP16499 860 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 MAP3K12Q12852 859 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 SPATA5Q8NB90 893 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-211ENST00000636934 HAND2P61296 217 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 RNF214Q8ND24 703 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 BCORQ6W2J9 1755 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 ZMYM6O95789 1325 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.76■■□□□ 1.07
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CLN8-211ENST00000636934 FAM177BA6PVY3 158 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.76■■□□□ 1.07
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CLN8-211ENST00000636934 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.75■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 CTDNEP1O95476 244 aa21.75■■□□□ 1.07
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CLN8-211ENST00000636934 ALX1Q15699 326 aa21.75■■□□□ 1.07
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CLN8-211ENST00000636934 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 VPS72Q15906 364 aa21.74■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 AIDAQ96BJ3 306 aa21.74■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.74■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 PIP4K2BP78356 416 aa21.74■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.74■■□□□ 1.07
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CLN8-211ENST00000636934 RGS22Q8NE09 1264 aa21.74■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.74■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.74■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 APPP05067 770 aa21.73■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.73■■□□□ 1.07
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CLN8-211ENST00000636934 DOCK2Q92608 1830 aa21.72■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 CCDC192P0DO97 292 aa21.72■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.72■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.71■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 MAP3K11Q16584 847 aa21.71■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.71■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.71■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.71■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.71■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 GNAT2P19087 354 aa21.71■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 RASGRF1Q13972 1273 aa21.71■■□□□ 1.07
CLN8-211ENST00000636934 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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CLN8-211ENST00000636934 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.69■■□□□ 1.06
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CLN8-211ENST00000636934 ANTXR2P58335 489 aa21.69■■□□□ 1.06
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CLN8-211ENST00000636934 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.69■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 BICD2Q8TD16 824 aa21.69■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 NGLY1Q96IV0 654 aa21.69■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 TMEM87BQ96K49 555 aa21.69■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.69■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.69■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.69■■□□□ 1.06
CLN8-211ENST00000636934 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
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