RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626667.1

PCAT5-201, prostate cancer associated transcript 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT5, Length 3,550 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT5-201ENST00000626667 GPR153Q6NV75 609 aa8.18□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.18□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 CHGBP05060 677 aa8.18□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 PTPAQ15257 358 aa8.18□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.18□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 PTPRFP10586 1907 aa8.18□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 PLIN4Q96Q06 1357 aa8.18□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 FAM227BQ96M60 508 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 STK36Q9NRP7 1315 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 MLECQ14165 292 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 NCAPHQ15003 741 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 TMEM139Q8IV31 216 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 KBTBD3Q8NAB2 608 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 ANKRD7Q92527 254 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 MAST3O60307 1309 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 TM4SF1P30408 202 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 MED15Q96RN5 788 aa8.17□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 TBC1D12O60347 775 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 ATL3Q6DD88 541 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 NBR1Q14596 966 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 CCDC93Q567U6 631 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 SYCP1Q15431 976 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 USP48Q86UV5 1035 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 HSCBQ8IWL3 235 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.16□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 DPYSL4O14531 572 aa8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 OTOFQ9HC10 1997 aa8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 EDIL3O43854 480 aa8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 AMPHP49418 695 aa8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 TTC6Q86TZ1 520 aa8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.15□□□□□ -1.1
PCAT5-201ENST00000626667 M0R2C6 588 aa8.15□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.15□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ANKS1AQ92625 1134 aa8.15□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ZNF536O15090 1300 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 PBX1P40424 430 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 PSME1Q06323 249 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 SCRN1Q12765 414 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 COL4A5P29400 1685 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 CAMTA2O94983 1202 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 NTSR2O95665 410 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 UBE2HP62256 183 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 TCIRG1Q13488 830 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 PIGBQ92521 554 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.14□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 HIP1O00291 1037 aa8.13□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 SRGAP3O43295 1099 aa8.13□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.13□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa8.13□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 RIMBP2O15034 1052 aa8.13□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 SCARF1Q14162 830 aa8.13□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 SEC23AQ15436 765 aa8.13□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8.13□□□□□ -1.11
PCAT5-201ENST00000626667 A0A1W2PQ27 194 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms