RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
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TRAPPC3-210ENST00000617904 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-210ENST00000617904 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.19■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.19■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC3-210ENST00000617904 EPHX2P34913 555 aa20.17■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-210ENST00000617904 JDP2Q8WYK2 163 aa20.16■□□□□ 0.82
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-210ENST00000617904 VPS37DQ86XT2 251 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-210ENST00000617904 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC102BQ68D86 513 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC3-210ENST00000617904 BBOX1O75936 387 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-210ENST00000617904 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.13■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-210ENST00000617904 SNX21Q969T3 373 aa20.13■□□□□ 0.81
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PSMA5P28066 241 aa20.07■□□□□ 0.8
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PHKA1P46020 1223 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 VEGFBP49765 207 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 KRT32Q14532 448 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 NIM1KQ8IY84 436 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM227BQ96M60 508 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPIP5K2O43314 1243 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC3-210ENST00000617904 MCAMP43121 646 aa20.06■□□□□ 0.8
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