RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.94■■□□□ 1.1
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERFEQ4G0M1 354 aa21.81■■□□□ 1.08
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.81■■□□□ 1.08
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