RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 LMAN1P49257 510 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CABP4P57796 275 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ATP8B1O43520 1251 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GSDMDP57764 484 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MTX1Q13505 466 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 RAD50Q92878 1312 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PLCG2P16885 1265 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 KRT32Q14532 448 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ELF2Q15723 593 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 FSD1Q9BTV5 496 aa6.93□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SGSM2O43147 1006 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 HSPA4P34932 840 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 KRT85P78386 507 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 DCAF5Q96JK2 942 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ORAI2Q96SN7 254 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ELP1O95163 1332 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MYO1CO00159 1063 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PKP1Q13835 747 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 DRC1Q96MC2 740 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TMX1Q9H3N1 280 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ERLIN1O75477 346 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PHLPP1O60346 1717 aa6.92□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CAMK2BQ13554 666 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CUL4AQ13619 759 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 DOCK2Q92608 1830 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SKILP12757 684 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ATP6V1AP38606 617 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GORABQ5T7V8 394 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF790Q6PG37 636 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 BICD2Q8TD16 824 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 EVI5O60447 810 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 DDX11Q96FC9 970 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CEP83Q9Y592 693 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 LRP6O75581 1613 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 LRP5O75197 1615 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SMC2O95347 1197 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC172P0C7W6 258 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 NEK11Q8NG66 645 aa6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ANXA1P04083 346 aa6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MYL6BP14649 208 aa6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 GUCY2CP25092 1073 aa6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MAP2K2P36507 400 aa6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MNAT1P51948 309 aa6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MYD88Q99836 296 aa6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SEH1L-210ENST00000592582 STX6O43752 255 aa6.9□□□□□ -1.31
SEH1L-210ENST00000592582 CAPN2P17655 700 aa6.9□□□□□ -1.31
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