RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591652.1

ZNF559-209, Transcript of zinc finger protein 559, human

TSL 3

Gene ZNF559, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF559-209	ENST00000591652	HMX2	A2RU54	273 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	MED26	O95402	600 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	PREP	P48147	710 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	ARL4D	P49703	201 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	7.56	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	MEGF11	A6BM72	1044 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	COBL	O75128	1261 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	BMP3	P12645	472 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	IKBKE	Q14164	716 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	GJD3	Q8N144	294 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	ABL1	P00519	1130 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	FDX2	Q6P4F2	183 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	BEND4	Q6ZU67	534 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ZNF559-209	ENST00000591652	PRR19	A6NJB7	356 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	DLGAP3	O95886	979 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	GRIK1	P39086	918 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	USP26	Q9BXU7	913 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	METTL12	A8MUP2	240 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	TIAF1	O95411	115 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	SPINK2	P20155	84 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	SGO2	Q562F6	1265 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	MCTP1	Q6DN14	999 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	ICMT	O60725	284 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	ADAMTS4	O75173	837 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	GSTM4	Q03013	218 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	ECM1	Q16610	540 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	DTX1	Q86Y01	620 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	CCNJL	Q8IV13	435 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	UST	Q9Y2C2	406 aa		7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
ZNF559-209	ENST00000591652		A0A096LPE4	126 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652		A0A1W2PP55	124 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652		A0A1W2PPZ6	126 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	WDR64	B1ANS9	1081 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	DRD2	P14416	443 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	TCF12	Q99081	682 aa		7.46	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	RXRB	P28702	533 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	GRIA4	P48058	902 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	PCDH1	Q08174	1060 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		7.45	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652		H3BRB1	525 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	SERPINB4	P48594	390 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	IRAK1	P51617	712 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		7.44	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	F13B	P05160	661 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	ARHGAP4	P98171	946 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ZNF559-209	ENST00000591652	C14orf37	Q86TY3	774 aa		7.43	□□□□□ -1.22

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