RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	OSMR	Q99650	979 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	STOML1	Q9UBI4	398 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	MEGF11	A6BM72	1044 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227		A6NHS1	94 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	WISP1	O95388	367 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	NEFL	P07196	543 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	CDC25B	P30305	580 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	RNF208	Q9H0X6	261 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	EREG	O14944	169 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	ICMT	O60725	284 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	ADAM11	O75078	769 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	ABL1	P00519	1130 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	IGLV1-40	P01703	118 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	ACPP	P15309	386 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	MYRFL	Q96LU7	910 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	IKBKE	Q14164	716 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	NLRP12	P59046	1061 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	NDUFB5	O43674	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	TRPA1	O75762	1119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	NFIA	Q12857	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNAP23-215	ENST00000568227	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227		H3BRB1	525 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	GRIK1	P39086	918 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	PREP	P48147	710 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	CD97	P48960	835 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	BMP3	P12645	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	SSTR4	P31391	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	CCNJL	Q8IV13	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A096LPE4	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A1W2PP55	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	TIAF1	O95411	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	SERPINB4	P48594	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	ECM1	Q16610	540 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-215	ENST00000568227	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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