RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 IKBKEQ14164 716 aa7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 TMC7Q7Z402 723 aa7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 CCNJLQ8IV13 435 aa7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 NPHS2Q9NP85 383 aa7.01□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 METTL12A8MUP2 240 aa7□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 ITGB7P26010 798 aa7□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 MAPK1P28482 360 aa7□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 ARL4DP49703 201 aa7□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 C19orf57Q0VDD7 668 aa7□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 UBASH3BQ8TF42 649 aa7□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 TCF12Q99081 682 aa7□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 GLB1P16278 677 aa6.99□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.99□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 HGSNATQ68CP4 663 aa6.99□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.99□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.99□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 CSRNP1Q96S65 589 aa6.99□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 A0A096LPE4 126 aa6.98□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 A0A1W2PPZ6 126 aa6.98□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 GRIA4P48058 902 aa6.98□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 NLRP12P59046 1061 aa6.98□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 EHD4Q9H223 541 aa6.98□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 TREHO43280 583 aa6.97□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.97□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 CEP41Q9BYV8 373 aa6.97□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
GDE1-202ENST00000563645 PCDH1Q08174 1060 aa6.96□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 DSC3Q14574 896 aa6.96□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 ITPKAP23677 461 aa6.95□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.95□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.95□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 USP26Q9BXU7 913 aa6.95□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 RNF208Q9H0X6 261 aa6.95□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 ZNF576Q9H609 170 aa6.95□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 ABCB6Q9NP58 842 aa6.95□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 GSTM4Q03013 218 aa6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 GRM2Q14416 872 aa6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 UVSSAQ2YD98 709 aa6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 ASB16Q96NS5 453 aa6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.94□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.93□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.93□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 B3GALT4O96024 378 aa6.93□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 PLCB3Q01970 1234 aa6.93□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.93□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.93□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.93□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.92□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 MEGF11A6BM72 1044 aa6.92□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 FDX2Q6P4F2 183 aa6.92□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 PI16Q6UXB8 463 aa6.92□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.92□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.92□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.92□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 AEBP1Q8IUX7 1158 aa6.91□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.91□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 DLGAP3O95886 979 aa6.9□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 MAPK8P45983 427 aa6.9□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 PREPP48147 710 aa6.9□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.9□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 FBF1Q8TES7 1133 aa6.9□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 MYRFLQ96LU7 910 aa6.9□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.9□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 RAXQ9Y2V3 346 aa6.9□□□□□ -1.3
GDE1-202ENST00000563645 CYP11A1P05108 521 aa6.89□□□□□ -1.31
GDE1-202ENST00000563645 FSTP19883 344 aa6.89□□□□□ -1.31
GDE1-202ENST00000563645 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms