RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553417.1

PRMT5-208, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 3

Gene PRMT5, Length 259 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-208	ENST00000553417	MYO1B	O43795	1136 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	MCM10	Q7L590	875 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	PANK3	Q9H999	370 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	PSME4	Q14997	1843 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	MMP14	P50281	582 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	PRKCZ	Q05513	592 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	NLRP10	Q86W26	655 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF428	Q96B54	188 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	MXD3	Q9BW11	206 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	VEZT	Q9HBM0	779 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	MUC3A	Q02505	3323 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	INHA	P05111	366 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	CETP	P11597	493 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	FCGRT	P55899	365 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	DLGAP5	Q15398	846 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	CPA4	Q9UI42	421 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	CSAD	Q9Y600	493 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	CACNA1A	O00555	2505 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ALPK3	Q96L96	1907 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	DACT2	Q5SW24	774 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	NBPF3	Q9H094	633 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	XDH	P47989	1333 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	CLRN2	A0PK11	232 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ADCY3	O60266	1144 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	PRKAR2B	P31323	418 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	BTBD19	C9JJ37	291 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ELN	P15502	786 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	ATP2B4	P23634	1241 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	CTGF	P29279	349 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	SNAPC2	Q13487	334 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	DCTN1	Q14203	1278 aa		9.4	□□□□□ -0.9
PRMT5-208	ENST00000553417	PIEZO1	Q92508	2521 aa		9.4	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	OTOF	Q9HC10	1997 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	TNFAIP1	Q13829	316 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	VGLL4	Q14135	290 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	C17orf99	Q6UX52	265 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		9.39	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	9.38	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	9.38	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	RASA3	Q14644	834 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	FAM89A	Q96GI7	184 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	9.38	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	THEG	Q9P2T0	379 aa		9.38	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	MED23	Q9ULK4	1368 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	COL4A1	P02462	1669 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	FLT3LG	P49771	235 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	MAP3K9	P80192	1104 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	COA1	Q9GZY4	146 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	GABRQ	Q9UN88	632 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	PDHX	O00330	501 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	ANXA1	P04083	346 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PRMT5-208	ENST00000553417	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91

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