RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.04□□□□□ -0.96
USP15-218ENST00000552346 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
USP15-218ENST00000552346 PREPP48147 710 aa9.03□□□□□ -0.96
USP15-218ENST00000552346 C8orf34Q49A92 452 aa9.03□□□□□ -0.96
USP15-218ENST00000552346 BEND4Q6ZU67 534 aa9.03□□□□□ -0.96
USP15-218ENST00000552346 RGS22Q8NE09 1264 aa9.03□□□□□ -0.96
USP15-218ENST00000552346 TTC16Q8NEE8 873 aa9.03□□□□□ -0.96
USP15-218ENST00000552346 HELQQ8TDG4 1101 aa9.03□□□□□ -0.96
USP15-218ENST00000552346 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.03□□□□□ -0.96
USP15-218ENST00000552346 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.03□□□□□ -0.96
USP15-218ENST00000552346 PRR19A6NJB7 356 aa9.02□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 TRPA1O75762 1119 aa9.02□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 SPINK2P20155 84 aa9.02□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 FDX2Q6P4F2 183 aa9.02□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 HHIPQ96QV1 700 aa9.02□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 A6NHS1 94 aa9.01□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 PDGFAP04085 211 aa9.01□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 ARL4DP49703 201 aa9.01□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.01□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 PMEPA1Q969W9 287 aa9.01□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 SOX13Q9UN79 622 aa9.01□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 ADAMTS4O75173 837 aa9□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 C19orf57Q0VDD7 668 aa9□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 HGSNATQ68CP4 663 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 DTX1Q86Y01 620 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 CHRDQ9H2X0 955 aa8.99□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 MPSTP25325 297 aa8.98□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 TXKP42681 527 aa8.98□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 OSMRQ99650 979 aa8.98□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 MEGF11A6BM72 1044 aa8.97□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.97□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 WDR64B1ANS9 1081 aa8.97□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 BSNDQ8WZ55 320 aa8.97□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 NXPE3Q969Y0 559 aa8.97□□□□□ -0.97
USP15-218ENST00000552346 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 WNT11O96014 354 aa8.96□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 IKBKEQ14164 716 aa8.96□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.96□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.96□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.96□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 POLIQ9UNA4 740 aa8.96□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 MTMR7Q9Y216 660 aa8.96□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 BTBD11A6QL63 1104 aa8.95□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 EREGO14944 169 aa8.95□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 SGO2Q562F6 1265 aa8.95□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.95□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.95□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.95□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 USP26Q9BXU7 913 aa8.95□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 CARNS1A5YM72 827 aa8.94□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 PHACTR2O75167 634 aa8.94□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 EDN3P14138 238 aa8.94□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 RXRBP28702 533 aa8.94□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 MTMR3Q13615 1198 aa8.93□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 AAMPQ13685 434 aa8.93□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.93□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.93□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.93□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 ATG3Q9NT62 314 aa8.93□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 PIM2Q9P1W9 311 aa8.93□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.92□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 TNFRSF21O75509 655 aa8.92□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 FBXL6Q8N531 539 aa8.92□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.92□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.92□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.92□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.92□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 RNF114Q9Y508 228 aa8.92□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.91□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.91□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 TIAF1O95411 115 aa8.9□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 F13BP05160 661 aa8.9□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 SSFA2P28290 1259 aa8.9□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 EHHADHQ08426 723 aa8.9□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.9□□□□□ -0.98
USP15-218ENST00000552346 DLGAP3O95886 979 aa8.89□□□□□ -0.99
USP15-218ENST00000552346 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
USP15-218ENST00000552346 USP5P45974 858 aa8.89□□□□□ -0.99
USP15-218ENST00000552346 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.89□□□□□ -0.99
USP15-218ENST00000552346 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.89□□□□□ -0.99
USP15-218ENST00000552346 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.88□□□□□ -0.99
USP15-218ENST00000552346 DRD2P14416 443 aa8.88□□□□□ -0.99
USP15-218ENST00000552346 NPR3P17342 541 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms