RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, human

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRR-208	ENST00000549107	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	PDE6A	P16499	860 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	MCM2	P49736	904 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	XDH	P47989	1333 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	SEMA3E	O15041	775 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	BBOX1	O75936	387 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	PDE6B	P35913	854 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	GPSM2	P81274	684 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	TTC14	Q96N46	770 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	ZBTB22	O15209	634 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	GPAA1	O43292	621 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	NPR1	P16066	1061 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	TMC4	Q7Z404	712 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	FOXP2	O15409	715 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	SRGN	P10124	158 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	CPA1	P15085	419 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	ATP2B4	P23634	1241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	PSMA5	P28066	241 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	DDIT3	P35638	169 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	KRT32	Q14532	448 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	UFL1	O94874	794 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	CYP21A2	P08686	494 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	AK2	P54819	239 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	GGA1	Q9UJY5	639 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PTPRR-208	ENST00000549107	MBD4	O95243	580 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	CUL4A	Q13619	759 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	AIDA	Q96BJ3	306 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107		A0A0G2JLW4	131 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	CYP7A1	P22680	504 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC125	Q86Z20	511 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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