RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549101.1

USP15-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-211ENST00000549101 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
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USP15-211ENST00000549101 SLC7A3Q8WY07 619 aa10.12□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 WNT8BQ93098 351 aa10.12□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.12□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 IKBKEQ14164 716 aa10.11□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 PI16Q6UXB8 463 aa10.11□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 OSGEPQ9NPF4 335 aa10.11□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 NLRP2Q9NX02 1062 aa10.11□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
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USP15-211ENST00000549101 TXNRD3Q86VQ6 643 aa10.1□□□□□ -0.79
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USP15-211ENST00000549101 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
USP15-211ENST00000549101 TMEM130Q8N3G9 435 aa10.09□□□□□ -0.79
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USP15-211ENST00000549101 ALX3O95076 343 aa10.08□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 NOS3P29474 1203 aa10.08□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 ARL4DP49703 201 aa10.08□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 C19orf57Q0VDD7 668 aa10.08□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 DOC2BQ14184 412 aa10.08□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.08□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 SETDB2Q96T68 719 aa10.08□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 F8W735 103 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 ADAM11O75078 769 aa10.07□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 P4HBP07237 508 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 ZNF423Q2M1K9 1284 aa10.07□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.07□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 ABCB6Q9NP58 842 aa10.07□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.07□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 WISP1O95388 367 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 ITPKAP23677 461 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 PCDH1Q08174 1060 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 BCO2Q9BYV7 579 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.06□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 NLRP12P59046 1061 aa10.05□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP10.05□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 PPP4R2Q9NY27 417 aa10.05□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 ALG1LQ6GMV1 187 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 NXPE4Q6UWF7 544 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 ACAD11Q709F0 780 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 FBF1Q8TES7 1133 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 ZNF576Q9H609 170 aa10.04□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 FURINP09958 794 aa10.03□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 ATP2B2Q01814 1243 aa10.03□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 GSTM4Q03013 218 aa10.03□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 UBASH3BQ8TF42 649 aa10.03□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
USP15-211ENST00000549101 FCGRTP55899 365 aa10.02□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 CCDC27Q2M243 656 aa10.02□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.02□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 COL19A1Q14993 1142 aa10.01□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 B3GALT4O96024 378 aa10□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 DTHD1Q6ZMT9 781 aa10□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 OSBPL7Q9BZF2 842 aa10□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 GLB1P16278 677 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 FAAP100Q0VG06 881 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 Q6ZS46 218 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 TP53INP1Q96A56 240 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 USP26Q9BXU7 913 aa9.99□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.98□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 NRSN2Q9GZP1 204 aa9.98□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.97□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 DLGAP3O95886 979 aa9.97□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.97□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.97□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 SPG7Q9UQ90 795 aa9.97□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.97□□□□□ -0.81
USP15-211ENST00000549101 GIPC1O14908 333 aa9.96□□□□□ -0.82
USP15-211ENST00000549101 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
USP15-211ENST00000549101 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
USP15-211ENST00000549101 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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