RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	COBL	O75128	1261 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	TGFB1	P01137	390 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHA2	P01877	340 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	EPHA1	P21709	976 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	CDC25B	P30305	580 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	ABTB2	Q8N961	1025 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCC9	O60706	1549 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	TREH	O43280	583 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFB5	O43674	189 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPRA	P18433	802 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	DSC3	Q14574	896 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM19	Q9H013	955 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		6.55	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	NFIA	Q12857	509 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	MYRFL	Q96LU7	910 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	ELP3	Q9H9T3	547 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	USP35	Q9P2H5	1018 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	ADAM11	O75078	769 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF43	Q68DV7	783 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	ATCAY	Q86WG3	371 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	CITED4	Q96RK1	184 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM129B	Q96TA1	746 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF19A	Q9NV58	838 aa		6.53	□□□□□ -1.36
SNHG1-222	ENST00000545308	HMX2	A2RU54	273 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM177B	A6PVY3	158 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR182	O15218	404 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	PAX4	O43316	350 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	WNT8B	Q93098	351 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	CNTN3	Q9P232	1028 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	6.52	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308		H3BRJ5	948 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIK1	P39086	918 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	IRAK1	P51617	712 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	CABP4	P57796	275 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	PIP4K2B	P78356	416 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	PLCB3	Q01970	1234 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	EHHADH	Q08426	723 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	AAMP	Q13685	434 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	TMC1	Q8TDI8	760 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	BACH2	Q9BYV9	841 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	PRR19	A6NJB7	356 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	NFKBIE	O00221	500 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	SPINK2	P20155	84 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	XKR5	Q6UX68	686 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM161B	Q96MY7	647 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	SETDB2	Q96T68	719 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		6.5	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	BMP3	P12645	472 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	ACPP	P15309	386 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	MAPK8	P45983	427 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF208	Q9H0X6	261 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SNHG1-222	ENST00000545308	POLI	Q9UNA4	740 aa		6.49	□□□□□ -1.37

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