RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 AKNAQ7Z591 1439 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 LCE3BQ5TA77 95 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 RBSNQ9H1K0 784 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 MTMR3Q13615 1198 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 SLC51AQ86UW1 340 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.67□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 REREQ9P2R6 1566 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 F8W735 103 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 ALX3O95076 343 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 NLRP13Q86W25 1043 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 RICTORQ6R327 1708 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 PLCH2O75038 1416 aa6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 BTBD11A6QL63 1104 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 TNFRSF10BO14763 440 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 SETDB1Q15047 1291 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.65□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HDAC2-216ENST00000523628 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.65□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.65□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 FSTP19883 344 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 C16orf46Q6P387 395 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 COL26A1Q96A83 441 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 MUC3BQ9H195 1237 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 BCORL1Q5H9F3 1711 aa6.64□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZS46 218 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 OR13H1Q8NG92 308 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 PPME1Q9Y570 386 aa6.63□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 KDM5CP41229 1560 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB39O15060 712 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.62□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.62□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.61□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 PREX2Q70Z35 1606 aa6.61□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa6.61□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.61□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 HECW2Q9P2P5 1572 aa6.61□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.61□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.61□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ICMTO60725 284 aa6.61□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 AGLP35573 1532 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRMP28827 1452 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 MLH3Q9UHC1 1453 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ABL1P00519 1130 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 GLB1P16278 677 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP4P98171 946 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 HYAL2Q12891 473 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 RGS22Q8NE09 1264 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 SPACA7Q96KW9 195 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 RAXQ9Y2V3 346 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ATP10AO60312 1499 aa6.6□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.59□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 LINC01387J3KSC0 135 aa6.59□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 NPR3P17342 541 aa6.59□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 ATP11AP98196 1134 aa6.59□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 CEP135Q66GS9 1140 aa6.59□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
HDAC2-216ENST00000523628 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.59□□□□□ -1.35
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