RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 SASH1O94885 1247 aa8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 TMC4Q7Z404 712 aa8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 CRBNQ96SW2 442 aa8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 EYA2O00167 538 aa8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 SULF1Q8IWU6 871 aa8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.03□□□□□ -1.12
RRN3P1-201ENST00000514813 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 SHTN1A0MZ66 631 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 TFCP2Q12800 502 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXO4P98177 505 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP2K5Q13163 448 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 AMHR2Q16671 573 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 AACSQ86V21 672 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 USP17L3A6NCW0 530 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 USP17L4A6NCW7 530 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 MYO1BO43795 1136 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 RFX1P22670 979 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 DLGAP5Q15398 846 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 USP17L8P0C7I0 530 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 DLK2Q6UY11 383 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 CDHR2Q9BYE9 1310 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT26Q7Z3Y9 468 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 TOMM70O94826 608 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 PRELPP51888 382 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 TCP10Q12799 353 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 USP48Q86UV5 1035 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.01□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 LY75O60449 1722 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 C1QTNF8P60827 252 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 MFSD10Q14728 455 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGAP45Q92619 1136 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 PSMD1Q99460 953 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 CD209Q9NNX6 404 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1B0GUL7 405 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 PDE8BO95263 885 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 DSG3P32926 999 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 CACNB3P54284 484 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 CNTROBQ8N137 903 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 GPC2Q8N158 579 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 GOPCQ9HD26 462 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 UBR3Q6ZT12 1888 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 CEP350Q5VT06 3117 aa8□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAF5O00463 557 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 PICALMQ13492 652 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 PODNQ7Z5L7 613 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 RREB1Q92766 1687 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 ADORA1P30542 326 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 CELF2O95319 508 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 KAZALD1Q96I82 304 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 GGA3Q9NZ52 723 aa7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 CSF1RP07333 972 aa7.98□□□□□ -1.13
RRN3P1-201ENST00000514813 PRR29P0C7W0 189 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms