RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 AGMOQ6ZNB7 445 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 UBP1Q9NZI7 540 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 CTBSQ01459 385 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 IGFLR1Q9H665 355 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 TLDC2A0PJX2 215 aa11.53□□□□□ -0.56
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PGGT1B-205ENST00000514178 RPS26P62854 115 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 MUC3BQ9H195 1237 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
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PGGT1B-205ENST00000514178 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 APOBRQ0VD83 1088 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 KIFC2Q96AC6 838 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 NBPF4Q96M43 638 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 SENP2Q9HC62 589 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ETFBP38117 255 aa11.51□□□□□ -0.57
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PGGT1B-205ENST00000514178 SYT9Q86SS6 491 aa11.51□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 RBSNQ9H1K0 784 aa11.51□□□□□ -0.57
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PGGT1B-205ENST00000514178 TBX22Q9Y458 520 aa11.51□□□□□ -0.57
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PGGT1B-205ENST00000514178 SERINC3Q13530 473 aa11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 PCSK7Q16549 785 aa11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP135Q66GS9 1140 aa11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 NKD1Q969G9 470 aa11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 BSNDQ8WZ55 320 aa11.49□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM47Q96LD4 638 aa11.49□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP2R3AQ06190 1150 aa11.48□□□□□ -0.57
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PGGT1B-205ENST00000514178 RASIP1Q5U651 963 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.48□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.48□□□□□ -0.57
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PGGT1B-205ENST00000514178 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 SIN3BO75182 1162 aa11.47□□□□□ -0.57
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PGGT1B-205ENST00000514178 SEZ6Q53EL9 994 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 SDE2Q6IQ49 451 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO27Q8NI29 283 aa11.47□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC3Q9BY71 257 aa11.47□□□□□ -0.57
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PGGT1B-205ENST00000514178 ROBO2Q9HCK4 1378 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 C2CD2LO14523 706 aa11.46□□□□□ -0.57
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PGGT1B-205ENST00000514178 B3GALT4O96024 378 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CPB1P15086 417 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 LMNB1P20700 586 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM35AQ86V20 835 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 PLD4Q96BZ4 506 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.46□□□□□ -0.57
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PGGT1B-205ENST00000514178 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.46□□□□□ -0.57
PGGT1B-205ENST00000514178 SOX13Q9UN79 622 aa11.46□□□□□ -0.57
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PGGT1B-205ENST00000514178 KLF4O43474 513 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 BMP4P12644 408 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 BMP6P22004 513 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 LAPTM4AQ15012 233 aa11.45□□□□□ -0.58
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PGGT1B-205ENST00000514178 VN1R5Q7Z5H4 357 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 JAZF1Q86VZ6 243 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 NAGPAQ9UK23 515 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 PPT2Q9UMR5 302 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC6A14Q9UN76 642 aa11.45□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 PPFIA3O75145 1194 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 PTPRAP18433 802 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 NME2P22392 152 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF423Q2M1K9 1284 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 MICALL1Q8N3F8 863 aa11.44□□□□□ -0.58
PGGT1B-205ENST00000514178 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
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