RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPSM2P81274 684 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AIDAQ96BJ3 306 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RAI14Q9P0K7 980 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABCF2Q9UG63 623 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1B0GUL6 1792 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MED23Q9ULK4 1368 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ADD2P35612 726 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GSTO1P78417 241 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNAP23O00161 211 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDE6AP16499 860 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEK4P51957 841 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLF2Q8IX21 1173 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MTFR1LQ9H019 292 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 APPP05067 770 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LDHCP07864 332 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SOGA3Q5TF21 947 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PI16Q6UXB8 463 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CERS3Q8IU89 383 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS2-201ENST00000513533 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PTH1RQ03431 593 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NECTIN1Q15223 517 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANKRD1Q15327 319 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IL17RAQ96F46 866 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COA1Q9GZY4 146 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAST3O60307 1309 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GPAA1O43292 621 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYP7A1P22680 504 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TGFB2P61812 414 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TTLL6Q8N841 843 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF2CQ99661 725 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SLC27A2O14975 620 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCNB2Q92953 911 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OSBP2Q969R2 916 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 M0R2C6 588 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF213O14771 459 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BAG3O95817 575 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IL1R1P14778 569 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FGD1P98174 961 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRDNQ13061 729 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IL25Q9H293 177 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CD209Q9NNX6 404 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DOCK2Q92608 1830 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POLLQ9UGP5 575 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL4A1P02462 1669 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RIMBP2O15034 1052 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MBD4O95243 580 aa14.53□□□□□ -0.08
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZBTB7AO95365 584 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms