RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512299.5

PAQR3-208, Transcript of progestin and adipoQ receptor family member 3, human

TSL 4

Gene PAQR3, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAQR3-208	ENST00000512299	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.83	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	ZBTB22	O15209	634 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	AK2	P54819	239 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.82	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.82	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	SBF1	O95248	1867 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	RFC4	P35249	363 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	ZAP70	P43403	619 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.81	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	IGSF3	O75054	1194 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	MCAM	P43121	646 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	MAST3	O60307	1309 aa		11.8	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	ADD2	P35612	726 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	CHRND	Q07001	517 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	MAP3K12	Q12852	859 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	SCARF1	Q14162	830 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	GSE1	Q14687	1217 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.79	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	SEMA3E	O15041	775 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	BRD1	O95696	1058 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	PHKA1	P46020	1223 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PAQR3-208	ENST00000512299	TRAK2	O60296	914 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	CYP21A2	P08686	494 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299		M0R2C6	588 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	ALX1	Q15699	326 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	GPAA1	O43292	621 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	PDE6A	P16499	860 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	PDC	P20941	246 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	RASGRF1	Q13972	1273 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	NPHP1	O15259	732 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	CHGB	P05060	677 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	GNAT2	P19087	354 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	NFIX	Q14938	502 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	ME3	Q16798	604 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PAQR3-208	ENST00000512299	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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