RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502274.1

SH3TC2-202, Transcript of SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3TC2, Length 2,681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2-202ENST00000502274 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 AK7Q96M32 723 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 ARFGAP3Q9NP61 516 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 MYO1CO00159 1063 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 CCDC191Q8NCU4 936 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 FMNL2Q96PY5 1086 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 FUT8Q9BYC5 575 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 MRC1P22897 1456 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 GRM8O00222 908 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 IQUBQ8NA54 791 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 VWA3AA6NCI4 1184 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 CBFA2T2O43439 604 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 ATP5JP18859 108 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 STOX1Q6ZVD7 989 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 KCNG4Q8TDN1 519 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 SIL1Q9H173 461 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 EPC1Q9H2F5 836 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 KCNQ3O43525 872 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 APOBRQ0VD83 1088 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 RABGGTAQ92696 567 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 ADAM21Q9UKJ8 722 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 LAMA4Q16363 1823 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 LINS1Q8NG48 757 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 LGR6Q9HBX8 967 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 ATG3Q9NT62 314 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 ZNF609O15014 1411 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3TC2-202ENST00000502274 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 BIN1O00499 593 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 ARHGAP6O43182 974 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 YEATS4O95619 227 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 ATP1A3P13637 1013 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 GUCY1B3Q02153 619 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 PARD6BQ9BYG5 372 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 MRFAP1Q9Y605 127 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 PIK3C2AO00443 1686 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 ZNF202O95125 648 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 CASQ1P31415 396 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 UBASH3AP57075 661 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 NLRP6P59044 892 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 CCT2P78371 535 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 STK38Q15208 465 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 VSTM4Q8IW00 320 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 POLR3EQ9NVU0 708 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 LCMT1Q9UIC8 334 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 CARMIL3Q8ND23 1372 aa16.14■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 TMEM139Q8IV31 216 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 SRLQ86TD4 932 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 CLIC4Q9Y696 253 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 MAP2K7O14733 419 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 SPTLC2O15270 562 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 MYO1BO43795 1136 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 ACTN2P35609 894 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 C10orf67Q8IYJ2 551 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 DPF2Q92785 391 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 CCDC151A5D8V7 595 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 TRIM66O15016 1216 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 FDPSP14324 419 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 WDR24Q96S15 920 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 CTR9Q6PD62 1173 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 ABTB2Q8N961 1025 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 TUBE1Q9UJT0 475 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 BTBD11A6QL63 1104 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 SERPINC1P01008 464 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 TOP1P11387 765 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 CMA1P23946 247 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 GNG11P61952 73 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 MYL5Q02045 173 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 BRD3Q15059 726 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 PROSER3Q2NL68 480 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3TC2-202ENST00000502274 GOLGA1Q92805 767 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms