RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.09□□□□□ -1.43
CMC1-211ENST00000495428 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.09□□□□□ -1.43
CMC1-211ENST00000495428 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 ARL4DP49703 201 aa6.08□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 Q6ZS46 218 aa6.08□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 CCNJLQ8IV13 435 aa6.08□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.08□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 TP53INP1Q96A56 240 aa6.08□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.08□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.08□□□□□ -1.44
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CMC1-211ENST00000495428 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 DYRK3O43781 588 aa6.07□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 ALX3O95076 343 aa6.07□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 WISP1O95388 367 aa6.07□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.07□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 IKBKEQ14164 716 aa6.07□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.07□□□□□ -1.44
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CMC1-211ENST00000495428 ACAD11Q709F0 780 aa6.07□□□□□ -1.44
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CMC1-211ENST00000495428 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.07□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.07□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 METTL12A8MUP2 240 aa6.06□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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CMC1-211ENST00000495428 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.06□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.06□□□□□ -1.449e-8■■■■□ 20.1
CMC1-211ENST00000495428 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.06□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 CSRNP1Q96S65 589 aa6.06□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 TCF12Q99081 682 aa6.06□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 NPHS2Q9NP85 383 aa6.06□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 A0A096LPE4 126 aa6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 A0A1W2PPZ6 126 aa6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 GLB1P16278 677 aa6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 ITGB7P26010 798 aa6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 MAPK1P28482 360 aa6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 NLRP12P59046 1061 aa6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 CEP41Q9BYV8 373 aa6.05□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 GRIA4P48058 902 aa6.04□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 DSC3Q14574 896 aa6.04□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 HGSNATQ68CP4 663 aa6.04□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 EHD4Q9H223 541 aa6.04□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 TREHO43280 583 aa6.03□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 PLCB3Q01970 1234 aa6.03□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 PCDH1Q08174 1060 aa6.03□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.03□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CMC1-211ENST00000495428 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.03□□□□□ -1.44
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CMC1-211ENST00000495428 ITPKAP23677 461 aa6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 UVSSAQ2YD98 709 aa6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 RNF208Q9H0X6 261 aa6.02□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 MEGF11A6BM72 1044 aa6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 ASB16Q96NS5 453 aa6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 USP26Q9BXU7 913 aa6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 ZNF576Q9H609 170 aa6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 ABCB6Q9NP58 842 aa6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.01□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 B3GALT4O96024 378 aa6□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 GSTM4Q03013 218 aa6□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 GRM2Q14416 872 aa6□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 DHX15O43143 795 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 NUTM2GQ5VZR2 741 aa5.99□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 FDX2Q6P4F2 183 aa5.99□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 SLC51AQ86UW1 340 aa5.99□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.99□□□□□ -1.45
CMC1-211ENST00000495428 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.99□□□□□ -1.45
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