RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492460.5

CACNA2D3-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

TSL 4

Gene CACNA2D3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-211ENST00000492460 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 FSCN2O14926 492 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 APBA3O96018 575 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 SELPP16109 830 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 CD163Q86VB7 1156 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 BCO2Q9BYV7 579 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 RNF19AQ9NV58 838 aa6.45□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 DLL1O00548 723 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.44□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 TM4SF5O14894 197 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 FCGRTP55899 365 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 PIP4K2BP78356 416 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 IKBKEQ14164 716 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 FBF1Q8TES7 1133 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 USP21Q9UK80 565 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.43□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 ADAM11O75078 769 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 WISP1O95388 367 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 ITPKAP23677 461 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 NLRP12P59046 1061 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 PCDH1Q08174 1060 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 NACC1Q96RE7 527 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 ZNF576Q9H609 170 aa6.42□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 CD68P34810 354 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 COL19A1Q14993 1142 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.41□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 C9orf172C9J069 976 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 GSTM4Q03013 218 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 MBTPS1Q14703 1052 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 WNT8BQ93098 351 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 SPG7Q9UQ90 795 aa6.4□□□□□ -1.38
CACNA2D3-211ENST00000492460 ALX3O95076 343 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 PROCP04070 461 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 ARL4DP49703 201 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 FAAP100Q0VG06 881 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 ADGRE1Q14246 886 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 ACAD11Q709F0 780 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 FAM161BQ96MY7 647 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 USP26Q9BXU7 913 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 C12orf49Q9H741 205 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.39□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 B3GALT4O96024 378 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 GNA15P30679 374 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 DUOXA2Q1HG44 320 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 PARP2Q9UGN5 583 aa6.38□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 F8W735 103 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 MSTNO14793 375 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 FBXO24O75426 580 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 USP17L7P0C7H9 530 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 NOS3P29474 1203 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 GATA4P43694 442 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 BCL11AQ9H165 835 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.37□□□□□ -1.39
CACNA2D3-211ENST00000492460 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms