RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489845.1

DCLRE1C-215, Transcript of DNA cross-link repair 1C, human

TSL 3

Gene DCLRE1C, Length 294 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCLRE1C-215	ENST00000489845	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ECEL1	O95672	775 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	CDC27	P30260	824 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	GNA15	P30679	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	DAB2	P98082	770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	GRIK4	Q16099	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DCLRE1C-215	ENST00000489845	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	GNB5	O14775	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ADAM11	O75078	769 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	WISP1	O95388	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	CTSB	P07858	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	PTPRA	P18433	802 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	SMARCA4	P51532	1647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ITGB2	P05107	769 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ERCC3	P19447	782 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ITPKA	P23677	461 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	PSMD2	Q13200	908 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	RASIP1	Q5U651	963 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	TMC4	Q7Z404	712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	STK17A	Q9UEE5	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	AK5	Q9Y6K8	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	KRBA1	A5PL33	1030 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845		F6X3S4	739 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845		H3BRJ5	948 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	FSCN2	O14926	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	PAGE1	O75459	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	DLGAP3	O95886	979 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	SELP	P16109	830 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ALX3	O95076	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	RECK	O95980	971 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	CELA3A	P09093	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	NLRP12	P59046	1061 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	IKBKE	Q14164	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	CUX2	O14529	1486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	DLL1	O00548	723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ENC1	O14682	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	CHRNA4	P43681	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	SORBS3	O60504	671 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	B3GALT4	O96024	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	GSTM4	Q03013	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	DCAF5	Q96JK2	942 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DCLRE1C-215	ENST00000489845	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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