RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485729.1

HFE-212, Transcript of homeostatic iron regulator, humanhuman

TSL 3

Gene HFE, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFE-212ENST00000485729 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.02□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 SHPRHQ149N8 1683 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 PZPP20742 1482 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 MSH6P52701 1360 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 MMP20O60882 483 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 MAPK8P45983 427 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 CHRDQ9H2X0 955 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 EFCC1Q9HA90 598 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 MBIPQ9NS73 344 aa7.01□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 PLXNC1O60486 1568 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 PHACTR2O75167 634 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 MAP3K6O95382 1288 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 NEFLP07196 543 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 KRT76Q01546 638 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 LCE2CQ5TA81 110 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 SYT9Q86SS6 491 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 IRF7Q92985 503 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 CSRNP1Q96S65 589 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 KLF15Q9UIH9 416 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 PREX2Q70Z35 1606 aa7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 NEUROD1Q13562 356 aa6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 OR13H1Q8NG92 308 aa6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 GIPC2Q8TF65 315 aa6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 C8orf37Q96NL8 207 aa6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 SETDB2Q96T68 719 aa6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 EID1Q9Y6B2 187 aa6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.99□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 ADGBQ8N7X0 1667 aa6.98□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 EREGO14944 169 aa6.98□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 KCNA6P17658 529 aa6.98□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 CES1P23141 567 aa6.98□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 MAP2K3P46734 347 aa6.98□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 ZNF428Q96B54 188 aa6.98□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 MAP3K1Q13233 1512 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 SIN3BO75182 1162 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 PSAPP07602 524 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 ARAFP10398 606 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 NWD1Q149M9 1564 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 PMEPA1Q969W9 287 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 IGFLR1Q9H665 355 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HFE-212ENST00000485729 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 LTKP29376 864 aa6.96□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 SOX18P35713 384 aa6.96□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 PLAURQ03405 335 aa6.96□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.96□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.96□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.96□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 TIAM1Q13009 1591 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 KIF3BO15066 747 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 WFS1O76024 890 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 ADH6P28332 368 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 GMPRP36959 345 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 NRLP54845 237 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 ATP2B2Q01814 1243 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HFE-212ENST00000485729 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms