RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 VEZTQ9HBM0 779 aa20.28■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.27■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 CLRN2A0PK11 232 aa20.27■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 CTSWP56202 376 aa20.27■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 KIF22Q14807 665 aa20.26■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 NEUROD2Q15784 382 aa20.26■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.26■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.26■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 ANP32CO43423 234 aa20.25■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.25■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 SPEF2Q9C093 1822 aa20.25■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 KLRK1P26718 216 aa20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 CCL15Q16663 113 aa20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 GREM2Q9H772 168 aa20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.24■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 F8W031 263 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 CFAP100Q494V2 611 aa20.23■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 SHISA4Q96DD7 197 aa20.23■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.23■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 KCNJ4P48050 445 aa20.22■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 GTF2A2P52657 109 aa20.22■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 RASA3Q14644 834 aa20.22■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.22■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.22■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.22■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 COL6A3P12111 3177 aa20.22■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 A0A0C4DFX4 3053 aa20.22■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.21■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.21■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 SPDYE6P0CI01 402 aa20.21■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.21■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.21■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 PRO3102Q9H379 93 aa20.21■□□□□ 0.83
SRPRB-204ENST00000484684 GNRH1P01148 92 aa20.2■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 MTFR1Q15390 333 aa20.2■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 CERS5Q8N5B7 392 aa20.2■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.2■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 OTOFQ9HC10 1997 aa20.19■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 PRMT2P55345 433 aa20.19■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 MRS2Q9HD23 443 aa20.19■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 CD209Q9NNX6 404 aa20.19■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 A0A1W2PPC1 479 aa20.18■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 TLR2O60603 784 aa20.18■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 TNFAIP1Q13829 316 aa20.18■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.18■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 VGLL4Q14135 290 aa20.17■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 LRCH3Q96II8 777 aa20.17■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.17■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 CSADQ9Y600 493 aa20.17■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.16■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 AOX1Q06278 1338 aa20.16■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 GJA8P48165 433 aa20.15■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 RAET1EQ8TD07 263 aa20.15■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.15■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 MYH3P11055 1940 aa20.15■□□□□ 0.82
SRPRB-204ENST00000484684 GJB1P08034 283 aa20.14■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 CETPP11597 493 aa20.14■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 GRK4P32298 578 aa20.14■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 MAP3K9P80192 1104 aa20.14■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.14■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 RNF208Q9H0X6 261 aa20.14■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.14■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 CCL5P13501 91 aa20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 ITGA6P23229 1130 aa20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 HOXD10P28358 340 aa20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 CHRNDQ07001 517 aa20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 MBIPQ9NS73 344 aa20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 SRRDQ9UH36 339 aa20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 JAG2Q9Y219 1238 aa20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.13■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 BTBD19C9JJ37 291 aa20.12■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 EVI5O60447 810 aa20.12■□□□□ 0.81
SRPRB-204ENST00000484684 PSMC4P43686 418 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms