RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 CHST3Q7LGC8 479 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 CCZ1BP86790 482 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 NYAP1Q6ZVC0 841 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 MYO1CO00159 1063 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF26B4DH59 902 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF14Q5TI25 921 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF15Q8N660 670 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 MAP4K1Q92918 833 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP45Q9UL16 551 aa18.79■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 ST3GAL1Q11201 340 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 CCT2P78371 535 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINC1P01008 464 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 GSDMDP57764 484 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC24Q50LG9 513 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 NCAPD2Q15021 1401 aa18.77■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 GNG11P61952 73 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 DRC1Q96MC2 740 aa18.77■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GVL5 298 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0G2JLW4 131 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP100Q494V2 611 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 VPS18Q9P253 973 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 HIP1O00291 1037 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 TULP2O00295 520 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 IQCB1Q15051 598 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 GPTP24298 496 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 TAF5LO75529 589 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZUG5 572 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 SYNE4Q8N205 404 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC102AQ96A19 550 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 FAM89AQ96GI7 184 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 COPRSQ9NQ92 184 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 RPS6KB1P23443 525 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD1Q15327 319 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 UTYO14607 1347 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 ELP1O95163 1332 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 APPP05067 770 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 HAND2P61296 217 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 CAVIN2O95810 425 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 NEK1Q96PY6 1258 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 STK38Q15208 465 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 LMO7Q8WWI1 1683 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 E2F4Q16254 413 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 WASHC4Q2M389 1173 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 CYP21A2P08686 494 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 CASQ1P31415 396 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 KARSQ15046 597 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-204ENST00000483092 ATP5JP18859 108 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 DPCR1Q3MIW9 517 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 CTAGE5O15320 804 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 CDC25BP30305 580 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 ARMCX5Q6P1M9 558 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 BRINP3Q76B58 766 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 USP28Q96RU2 1077 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 SLIT3O75094 1523 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 COL15A1P39059 1388 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC150Q8NCX0 1101 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-204ENST00000483092 MST1RQ04912 1400 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms