RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ATP2B4P23634 1241 aa5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ITGB8P26012 769 aa5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 SLFNL1Q499Z3 407 aa5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 KMT5BQ4FZB7 885 aa5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ANKMY2Q8IV38 441 aa5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 INSRP06213 1382 aa5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 CDH23Q9H251 3354 aa5.52□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 CEP162Q5TB80 1403 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 TCF3P15923 654 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 NCOA4Q13772 614 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 MORN1Q5T089 497 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 WNT2BQ93097 391 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ARMC5Q96C12 935 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 C11orf16Q9NQ32 467 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 CEP126Q9P2H0 1117 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 HCSTQ9UBK5 93 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 GPSM3Q9Y4H4 160 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 LAMB2P55268 1798 aa5.51□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF541Q9H0D2 1346 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 SOWAHBA6NEL2 793 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 GPR25O00155 361 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 GCP02774 474 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 VAMP1P23763 118 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 SERPINB4P48594 390 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 HUNKP57058 714 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 MAP7D1Q3KQU3 841 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 BICDL1Q6ZP65 573 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 RNF135Q8IUD6 432 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 GIPC2Q8TF65 315 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 USP24Q9UPU5 2620 aa5.5□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ANKARQ7Z5J8 1434 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 PPP4CP60510 307 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 TMF1P82094 1093 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ERMP1Q7Z2K6 904 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 TRIM50Q86XT4 487 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 PHTF2Q8N3S3 785 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 USP38Q8NB14 1042 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 PLPP7Q8NBV4 271 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 GDF15Q99988 308 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 CHIC2Q9UKJ5 165 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 TRIM17Q9Y577 477 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 USP47Q96K76 1375 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 DLEC1Q9Y238 1755 aa5.49□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 BMP8BP34820 402 aa5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ATP1A2P50993 1020 aa5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 PTK2Q05397 1052 aa5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 DPYDQ12882 1025 aa5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 EML3Q32P44 896 aa5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 RGMBQ6NW40 437 aa5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 OGFOD1Q8N543 542 aa5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 MYLIPQ8WY64 445 aa5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 FKTNO75072 461 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 MYCP01106 439 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 PTPRNQ16849 979 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 OTOP1Q7RTM1 612 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 LARGE2Q8N3Y3 721 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 TTLL6Q8N841 843 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ARMC2Q8NEN0 867 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF333Q96JL9 665 aa5.47□□□□□ -1.53
SHQ1-208ENST00000482785 PRR14Q9BWN1 585 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms